RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 GIMAP1Q8WWP7 306 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB9BQ9NP90 201 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV6A0A075B6T7 132 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFB3O43676 98 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 MECP2P51608 486 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 TAF9BQ9HBM6 251 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 PEX14O75381 377 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 AKAP6Q13023 2319 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 PPIHO43447 177 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 LY6HO94772 140 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 SELLP14151 372 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 SSTR2P30874 369 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 EDDM3BP56851 147 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 IGSF11Q5DX21 431 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 LPAR3Q9UBY5 353 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 MIOXQ9UGB7 285 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GW55 424 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 PRAF2O60831 178 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 DUX4L2P0CJ85 424 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 DUX4L3P0CJ86 424 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 DUX4L4P0CJ87 422 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 DUX4L5P0CJ88 424 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 DUX4L6P0CJ89 424 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 DUX4L7P0CJ90 424 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 HERPUD1Q15011 391 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 SPICQ8N5J4 248 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 DUX4Q9UBX2 424 aa25.78■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 DCHS2Q6V1P9 2916 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR37O15354 613 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 AADACL3Q5VUY0 350 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 LYPD2Q6UXB3 125 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 TPRX1Q8N7U7 411 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 OR13A1Q8NGR1 328 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10J5Q8NHC4 309 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 GALMQ96C23 342 aa25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CAPNS1-206ENST00000588815 C12orf77C9JDV5 145 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 FPR2P25090 351 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 FCGR2CP31995 323 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 MRGPRDQ8TDS7 321 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 CORO2AQ92828 525 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 MRGPRFQ96AM1 343 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 KIRREL1Q96J84 757 aa25.76■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 BET1O15155 118 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 SPINT2O43291 252 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFS7O75251 213 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 NDUFB7P17568 137 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 TATDN3Q17R31 274 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 NLRC3Q7RTR2 1065 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 CTSZQ9UBR2 303 aa25.75■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV39A0A0B4J263 110 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 hADV38S2A0JD32 116 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 DVL1O14640 695 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 PAX1P15863 534 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 FLVCR2Q9UPI3 526 aa25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 TUSC2O75896 110 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 RLN1P04808 185 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 IL2RGP31785 369 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 UCP3P55916 312 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 AVPI1Q5T686 147 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 MOB3AQ96BX8 217 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC23A1Q9UHI7 598 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR132Q9UNW8 380 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC00312Q9Y6C7 94 aa25.73■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5H14A6NHG9 310 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 HBZP02008 142 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 IL5P05113 134 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS2P15880 293 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB25P24278 435 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 HERV-K104P61576 105 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 HTD2P86397 168 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 MARCH1Q8TCQ1 289 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 IL1F10Q8WWZ1 152 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 ARL11Q969Q4 196 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 TOLLIPQ9H0E2 274 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 C15orf65H3BRN8 121 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 PPYP01298 95 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV4-39P01824 125 aa25.72■■□□□ 1.71
CAPNS1-206ENST00000588815 HEXAP06865 529 aa25.72■■□□□ 1.71
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