RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-206ENST00000578093 FGF16O43320 207 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ACTL6BO94805 426 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 OR2H2O95918 312 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 IGKV1D-33P01593 117 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 IGKV1-33P01594 117 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 IGKV1D-12P01611 117 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 HSD17B1P14061 328 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ATP6V1B1P15313 513 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 SPNP16150 400 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 TMEM11P17152 192 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 PRKACAP17612 351 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRM-206ENST00000578093 SLC6A1P30531 599 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 GPR12P47775 334 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 REG1BP48304 166 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 POU3F4P49335 361 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 GNG10P50151 68 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 RIDAP52758 137 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 GNB1P62873 340 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 TMED1Q13445 227 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 HES1Q14469 280 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 HNF4GQ14541 408 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 GINS1Q14691 196 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 KIR2DS1Q14954 304 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 LTC4SQ16873 150 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 MICAQ29983 383 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 BCL2L15Q5TBC7 163 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRM-206ENST00000578093 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRM-206ENST00000578093 RTN4RL2Q86UN3 420 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 CATSPERDQ86XM0 798 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ELMOD2Q8IZ81 293 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 HS3ST5Q8IZT8 346 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 Q8N6K4 173 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 Q8N9W7 124 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 OR8U1Q8NH10 309 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF596Q8TC21 504 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 C4orf3Q8WVX3 66 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 TOMM40LQ969M1 308 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRM-206ENST00000578093 MCUR1Q96AQ8 359 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRM-206ENST00000578093 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 MRGBPQ9NV56 204 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ARL8BQ9NVJ2 186 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 KIAA1456Q9P272 454 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 DNAJB9Q9UBS3 223 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 OR52A1Q9UKL2 312 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRM-206ENST00000578093 I3L521 148 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRM-206ENST00000578093 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
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PTPRM-206ENST00000578093 HSPB6O14558 160 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRM-206ENST00000578093 CDK5Q00535 292 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 GPR50Q13585 617 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF146Q15072 292 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 SLC35D3Q5M8T2 416 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 LCN1P1Q5VSP4 162 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 OR2T5Q6IEZ7 315 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 OR52W1Q6IF63 320 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 Q6P435 159 aa3.04□□□□□ -1.92
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