RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	CST4	P01036	141 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	HCK	P08631	526 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	PATE4	P0C8F1	98 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	CHRNB4	P30926	498 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	PTGFR	P43088	359 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	EVX1	P49640	407 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	ART1	P52961	327 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	CAV3	P56539	151 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	DEFA1	P59665	94 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	DEFA3	P59666	94 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM3A	P98173	230 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	GPR176	Q14439	515 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	ARL6IP1	Q15041	203 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	ZMYND11	Q15326	602 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	TATDN3	Q17R31	274 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC7A6	Q92536	515 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	LYZL4	Q96KX0	146 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	S100A13	Q99584	98 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC22A4	Q9H015	551 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	CST11	Q9H112	138 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	NOX3	Q9HBY0	568 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	RDH8	Q9NYR8	311 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	ATRX	P46100	2492 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	MGA	Q8IWI9	3026 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	ATM	Q13315	3056 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	GGT3P	A6NGU5	568 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	OR5B21	A6NL26	309 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	C16orf97	H3BN30	126 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	HPGDS	O60760	199 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	UPK1B	O75841	260 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	NRAS	P01111	189 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	FSHB	P01225	129 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	CCNO	P22674	350 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	GLRA1	P23415	457 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	ATP1B3	P54709	279 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF92	Q03936	586 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	IL18	Q14116	193 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	RGS21	Q2M5E4	152 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	HES5	Q5TA89	166 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	CNIH2	Q6PI25	160 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	NAA40	Q86UY6	237 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	LYPD6	Q86Y78	171 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	RPRML	Q8N4K4	120 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	WDR31	Q8NA23	367 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	HAVCR1	Q96D42	359 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	VCX2	Q9H322	139 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	RHOF	Q9HBH0	211 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	DIABLO	Q9NR28	239 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	RAB22A	Q9UL26	194 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139		V9GYH0	126 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	LAMA5	O15230	3695 aa		5.87	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A087WZ39	114 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	GMDS	O60547	372 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	PTTG1	O95997	202 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	IGHV4-59	P01825	116 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	HLA-DQB1	P01920	261 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CNOT1-222	ENST00000570139	CRYAA	P02489	173 aa		5.86	□□□□□ -1.47

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