RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 MGMTP16455 207 aa13.74□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRHBPP24387 322 aa13.74□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MNDAP41218 407 aa13.74□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 HERPUD1Q15011 391 aa13.74□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM30BQ3MIR4 351 aa13.74□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 GLT8D1Q68CQ7 371 aa13.74□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF497Q6ZNH5 498 aa13.74□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q6ZTK2 550 aa13.74□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRSS48Q7RTY5 328 aa13.74□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM219Q86XT9 240 aa13.74□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR52M1Q8NGK5 317 aa13.74□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF702PQ9H963 129 aa13.74□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 LIN7BQ9HAP6 207 aa13.74□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF581Q9P0T4 197 aa13.74□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 BLOC1S6Q9UL45 172 aa13.74□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 J3QR06 171 aa13.73□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SSTR5P35346 364 aa13.73□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TPBGQ13641 420 aa13.73□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 C2orf68Q2NKX9 166 aa13.73□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSD17B12Q53GQ0 312 aa13.73□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB12Q6IQ22 244 aa13.73□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEACAM19Q7Z692 300 aa13.73□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CAPSLQ8WWF8 208 aa13.73□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SGCDQ92629 289 aa13.73□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPEQ96AT9 228 aa13.73□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q96M66 194 aa13.73□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SELENOIQ9C0D9 397 aa13.73□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MMP27Q9H306 513 aa13.73□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB26Q9ULW5 256 aa13.73□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 AIPO00170 330 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MT-ND4P03905 459 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 UCHL1P09936 223 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRMP19623 302 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 FUT3P21217 361 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 MADCAM1Q13477 382 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q3ZCU0 254 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 C1orf100Q5SVJ3 147 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 LIPKQ5VXJ0 399 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAT1Q6PIZ9 186 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRRTM1Q86UE6 522 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 GAPTQ8N292 157 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 KLHDC1Q8N7A1 406 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 C8orf31Q8N9H6 132 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 RFESDQ8TAC1 157 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CFHR4Q92496 578 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TOMM40LQ969M1 308 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSG11Q9UQ72 335 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SIGLEC9Q9Y336 463 aa13.72□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARL6IP5O75915 188 aa13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CD37P11049 281 aa13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CPEP16870 476 aa13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 RANBP1P43487 201 aa13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAB7AP51149 207 aa13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 GP2P55259 537 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 INSL4Q14641 139 aa13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 C6orf183Q5T699 404 aa13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM27D1Q5T7N8 215 aa13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM104Q8NE00 496 aa13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARL11Q969Q4 196 aa13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC90BQ9GZT6 254 aa13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 BANF2Q9H503 90 aa13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 SERTAD4Q9NUC0 356 aa13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 ETAA1Q9NY74 926 aa13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 PEX16Q9Y5Y5 336 aa13.71□□□□□ -0.21
CCNDBP1-211ENST00000567434 WNK1Q9H4A3 2382 aa13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 C15orf65H3BRN8 121 aa13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 M0QZK8 103 aa13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPINT2O43291 252 aa13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDCD6O75340 191 aa13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR2F2O95006 317 aa13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM106CPP0CH98 169 aa13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 HSMCR30P0CW71 290 aa13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF554Q86TJ5 538 aa13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 THNSL2Q86YJ6 484 aa13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR8H3Q8N146 312 aa13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 OR10X1Q8NGY0 326 aa13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCNG3Q8TAE7 436 aa13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNBD2Q96M20 576 aa13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa13.7□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAV39A0A0B4J263 110 aa13.69□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC22A1O15245 554 aa13.69□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 PEX14O75381 377 aa13.69□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 ATP6V1G2O95670 118 aa13.69□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 VSIG10L2P0DP72 767 aa13.69□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 HTR2CP28335 458 aa13.69□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 VHLP40337 213 aa13.69□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 LTC4SQ16873 150 aa13.69□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 UTF1Q5T230 341 aa13.69□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINC00311Q8N616 119 aa13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms