RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GU03	582 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	CEACAM1	P13688	526 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	DYNLT3	P51808	116 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	LPAL2	Q16609	132 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		15.71	■□□□□ 0.11
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	DEGS1	O15121	323 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	CHST1	O43916	411 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	SERPINE2	P07093	398 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	STX12	Q86Y82	276 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	TCEAL3	Q969E4	200 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	IP6K3	Q96PC2	410 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	GLRX2	Q9NS18	164 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1456	Q9P272	454 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	DMD	P11532	3685 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	HS3ST1	O14792	307 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	DFFB	O76075	338 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	S100A6	P06703	90 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	MPL	P40238	635 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	RAB2A	P61019	212 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	ATP5S	Q99766	215 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	TREM2	Q9NZC2	230 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC13	O75165	2243 aa		15.7	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559		J3QT63	122 aa		15.69	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	CST7	O76096	145 aa		15.69	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	SULT1A1	P50225	295 aa		15.69	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	NUFIP2	Q7Z417	695 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	RDH5	Q92781	318 aa		15.69	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	RAB40C	Q96S21	281 aa		15.69	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	OR51I2	Q9H344	312 aa		15.69	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		15.69	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		15.69	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		15.69	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559		J3QW42	95 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM50A	O95807	157 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	SP1	P08047	785 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	OR13C7	P0DN81	318 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	AGA	P20933	346 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	WNT5A	P41221	380 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	MEOX2	P50222	304 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	TLE4	Q04727	773 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559		Q8IYB0	196 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	GPHA2	Q96T91	129 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	GPR37	O15354	613 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	ZNHIT1	O43257	154 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	TNFSF12	O43508	249 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	HBE1	P02100	147 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF488	Q96MN9	340 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	FAM186A	A6NE01	2351 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GV50	99 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	RAB5A	P20339	215 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	MEOX1	P50221	254 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	SLC10A1	Q14973	349 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	GUCD1	Q96NT3	240 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	S100A12	P80511	92 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	MALSU1	Q96EH3	234 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	RARRES2	Q99969	163 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	GP6	Q9HCN6	339 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		15.67	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PPH5	198 aa		15.66	■□□□□ 0.1
RRN3-205	ENST00000563559	C5orf52	A6NGY3	159 aa		15.66	■□□□□ 0.1

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.9 ms