RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	MBD6	Q96DN6	1003 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SNX22	Q96L94	193 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SLC6A7	Q99884	636 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM165	Q9HC07	324 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067		Q9N2K0	584 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ING3	Q9NXR8	418 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF69	Q9UC07	566 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ALG5	Q9Y673	324 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	POLE	Q07864	2286 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATL1-208	ENST00000556067	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067		A6NNC1	897 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	MGST3	O14880	152 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	BET1	O15155	118 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	FABP7	O15540	132 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SPINT2	O43291	252 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	NDUFA2	O43678	99 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CCNK	O75909	580 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	NAPSA	O96009	420 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	PLAU	P00749	431 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	LHB	P01229	141 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	IL5	P05113	134 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF728	P0DKX0	622 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	PSG2	P11465	335 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ANXA3	P12429	323 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	AKR1C4	P17516	323 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GZMH	P20718	246 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	IL2RG	P31785	369 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	FCGR2C	P31995	323 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	BTC	P35070	178 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	NPY4R	P50391	375 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CARTPT	Q16568	116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	LIN54	Q6MZP7	749 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067		Q6ZS49	121 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CADM3	Q8N126	398 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	DYRK2	Q92630	601 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RAB1C	Q92928	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	BEX2	Q9BXY8	128 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	BEX1	Q9HBH7	125 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RTTN	Q86VV8	2226 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ATRX	P46100	2492 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067		A0A0A6YYJ9	748 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	NDUFB3	O43676	98 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RGS11	O94810	467 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GYPA	P02724	150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR4E1	P0C645	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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