RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548092.5

TRAFD1-204, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAFD1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-204ENST00000548092 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 PMPCAQ10713 525 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 ELOBQ15370 118 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 OR1Q1Q15612 314 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 UBE2V2Q15819 145 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 DUSP5Q16690 384 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 HAGHQ16775 308 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 ACTBL2Q562R1 376 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 C1orf100Q5SVJ3 147 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 OR4C11Q6IEV9 310 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 MFSD12Q6NUT3 480 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 ADAM5Q6NVV9 412 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC48A1Q6P1K1 146 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 OPN5Q6U736 354 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 IL17RELQ6ZVW7 336 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 TMED4Q7Z7H5 227 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 HOGA1Q86XE5 327 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 KMT5CQ86Y97 462 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 KIR2DL5AQ8N109 375 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 KDM8Q8N371 416 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 NPEPL1Q8NDH3 523 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 OR2L5Q8NG80 312 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 OR5T3Q8NGG3 340 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 OR52E1Q8NGJ3 308 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 OR5L2Q8NGL0 311 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 OR10J5Q8NHC4 309 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 TERB2Q8NHR7 220 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNRF4Q8WWF5 429 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 PSMF1Q92530 271 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 GLYATL1Q969I3 302 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM230Q96A57 120 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 FAM3DQ96BQ1 224 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 BPIFA2Q96DR5 249 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 SEC22AQ96IW7 307 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 ADGRG7Q96K78 797 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 C4orf45Q96LM5 186 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 AIF1LQ9BQI0 150 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 PIGQQ9BRB3 760 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 GINS3Q9BRX5 216 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 PCBD2Q9H0N5 130 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC35B3Q9H1N7 401 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC26A1Q9H2B4 701 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 RGCCQ9H4X1 137 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 TAF9BQ9HBM6 251 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 CDH20Q9HBT6 801 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 OR5AC2Q9NZP5 309 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC23A2Q9UGH3 650 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 KCNK6Q9Y257 313 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 MED31Q9Y3C7 131 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 FBXO7Q9Y3I1 522 aa3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 TRAV27A0A087WT01 109 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 A0A0G2JNG1 304 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 A0A1W2PPV9 198 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM210A6NLX4 147 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 OR2AG2A6NM03 316 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 K7N7A8 449 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 M0QZK8 103 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 DCTN6O00399 190 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 FCMRO60667 390 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 GGCTO75223 188 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 MTX2O75431 263 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 NDUFB2O95178 105 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 TXNDC12O95881 172 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 GCGP01275 180 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 PMP2P02689 132 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 LCATP04180 440 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 ARG1P05089 322 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 GYPBP06028 91 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 HEXBP07686 556 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 CXCL1P09341 107 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 GZMBP10144 247 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 DAOP14920 347 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 ZNF708P17019 499 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 CHATP28329 748 aa3.54□□□□□ -1.84
TRAFD1-204ENST00000548092 AQP2P41181 271 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms