RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 ZPBPQ9BS86 351 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 TMEM189A5PLL7 270 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 B4GALT1P15291 398 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 NTHL1P78549 312 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF117Q03924 483 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 SPATA46Q5T0L3 261 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 LYG1Q8N1E2 194 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 A8MXK9 166 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 OGG1O15527 345 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 DHRS3O75911 302 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 EPPINO95925 133 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 GPR3P46089 330 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 FMODQ06828 376 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 GLRX5Q86SX6 157 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 PDLIM7Q9NR12 457 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 GPR27Q9NS67 375 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 FGF17O60258 216 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 TSPAN2O60636 221 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 ISG15P05161 165 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 EDN1P05305 212 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 OR4A8P0C604 315 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 FUT5Q11128 374 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 IRF3Q14653 427 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 OR4D5Q8NGN0 318 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 WDR34Q96EX3 536 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 DAPP1Q9UN19 280 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 A0A1B0GU03 582 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF205O95201 554 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 EFNB1P98172 346 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 GAGE2BQ13066 116 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 GAGE2EQ4V326 116 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 LRP10Q7Z4F1 713 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 NEUROG1Q92886 237 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 GMLQ99445 158 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.6□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 PDCD6O75340 191 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 IGHV4-39P01824 125 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 DCDP81605 110 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 MMDQ15546 238 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 CLN8Q9UBY8 286 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 CHD4Q14839 1912 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 VDAC1P21796 283 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 SERF2P84101 59 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 COPS9Q8WXC6 57 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 TEPPQ6URK8 271 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 TMEM45BQ96B21 275 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 PAXXQ9BUH6 204 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 TXNRD2Q9NNW7 524 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 Q5BKY6 102 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 DNASE2BQ8WZ79 361 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa7.59□□□□□ -1.19
ATXN3-216ENST00000545170 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.59□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 PSG2P11465 335 aa7.59□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 TTC9CQ8N5M4 171 aa7.59□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.59□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 CCL27Q9Y4X3 112 aa7.59□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 LINC00869P0C866 280 aa7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 PRR35P0CG20 571 aa7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 M0QZ24 198 aa7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 F11P03951 625 aa7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 EFNB2P52799 333 aa7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 GNB2P62879 340 aa7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 HIKESHIQ53FT3 197 aa7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 MESTQ5EB52 335 aa7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.58□□□□□ -1.2
ATXN3-216ENST00000545170 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms