RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544777.1

KDM5A-211, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-211ENST00000544777 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.7□□□□□ -1.18
KDM5A-211ENST00000544777 A0A0J9YWU9 116 aa7.7□□□□□ -1.18
KDM5A-211ENST00000544777 KDM4BO94953 1096 aa7.7□□□□□ -1.18
KDM5A-211ENST00000544777 NDUFB8O95169 186 aa7.7□□□□□ -1.18
KDM5A-211ENST00000544777 IGKV1D-12P01611 117 aa7.7□□□□□ -1.18
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KDM5A-211ENST00000544777 PRR20BP86481 221 aa7.68□□□□□ -1.18
KDM5A-211ENST00000544777 PRR20AP86496 221 aa7.68□□□□□ -1.18
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KDM5A-211ENST00000544777 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.68□□□□□ -1.18
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KDM5A-211ENST00000544777 LYG2Q86SG7 212 aa7.68□□□□□ -1.18
KDM5A-211ENST00000544777 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
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KDM5A-211ENST00000544777 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.68□□□□□ -1.18
KDM5A-211ENST00000544777 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
KDM5A-211ENST00000544777 SLC23A1Q9UHI7 598 aa7.68□□□□□ -1.18
KDM5A-211ENST00000544777 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa7.68□□□□□ -1.18
KDM5A-211ENST00000544777 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa7.68□□□□□ -1.18
KDM5A-211ENST00000544777 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
KDM5A-211ENST00000544777 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.67□□□□□ -1.18
KDM5A-211ENST00000544777 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa7.67□□□□□ -1.18
KDM5A-211ENST00000544777 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.67□□□□□ -1.18
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