RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 STEAP1Q9UHE8 339 aa4.55□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 KIF25Q9UIL4 384 aa4.55□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 HILPDAQ9Y5L2 63 aa4.55□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A087X0M5 115 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAV24A0A0B4J272 114 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1B0GX30 115 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD65E5RJM6 399 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 J3QR06 171 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 PDCD6O75340 191 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 FCN3O75636 299 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 SCGNO76038 276 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 CDRT1O95170 752 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 CSF1P09603 554 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 CALCBP10092 127 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 MGMTP16455 207 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 GALP22466 123 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 CRHBPP24387 322 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 GADD45AP24522 165 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 HTR2CP28335 458 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR3A4PP47883 348 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 GABARAPL2P60520 117 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC35A2P78381 396 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC35B1P78383 322 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 TPBGQ13641 420 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 HES1Q14469 280 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 HERPUD1Q15011 391 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB11BQ15907 218 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 LY6EQ16553 131 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 HLA-DRB5Q30154 266 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 PIGYQ3MUY2 71 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 LIPKQ5VXJ0 399 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB12Q6IQ22 244 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 Q6ZSV7 163 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 C11orf42Q8N5U0 333 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 ZFP41Q8N8Y5 198 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 C8orf31Q8N9H6 132 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR4F17Q8NGA8 305 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR8H1Q8NGG4 311 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR10K1Q8NGX5 313 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 MRGPRDQ8TDS7 321 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 WFDC12Q8WWY7 111 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 ARL11Q969Q4 196 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 MUL1Q969V5 352 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 PHF21AQ96BD5 680 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 GALMQ96C23 342 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 CNBD2Q96M20 576 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR4F4Q96R69 305 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 CITED1Q99966 193 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00574Q9H8X3 128 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 IL36RNQ9UBH0 155 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 TCF19Q9Y242 345 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 PEX16Q9Y5Y5 336 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.54□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PPK0 400 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2F2O95006 317 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 MPIG6BO95866 241 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 UCHL1P09936 223 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 CPEP16870 476 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC6A1P30531 599 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 PLA1AQ53H76 456 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 XAF1Q6GPH4 301 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 HCP5Q6MZN7 132 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF497Q6ZNH5 498 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2W3Q7Z3T1 314 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00311Q8N616 119 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 COMMD1Q8N668 190 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF485Q8NCK3 441 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR4X2Q8NGF9 303 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR56B1Q8NGI3 324 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR4P4Q8NGL7 312 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 EDARADDQ8WWZ3 215 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 KIRREL1Q96J84 757 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 S1PR3Q99500 378 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 MGLLQ99685 303 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OCSTAMPQ9BR26 566 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 DUSP21Q9H596 190 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 OR2S2Q9NQN1 319 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 MOB4Q9Y3A3 225 aa4.53□□□□□ -1.68
CLSTN3-215ENST00000544584 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
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