RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 EDDM3BP56851 147 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 NCS1P62166 190 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 LSM3P62310 102 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 MXD1Q05195 221 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 EDDM3AQ14507 147 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 HERPUD1Q15011 391 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 CTF1Q16619 201 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 KRBOX4Q5JUW0 171 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 GPR107Q5VW38 600 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 LYG1Q8N1E2 194 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 CORO2AQ92828 525 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 COQ2Q96H96 371 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 BARHL1Q9BZE3 327 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 SIRPDQ9H106 197 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 KCNK15Q9H427 330 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 C16orf95Q9H693 158 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.08□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A1W2PPE2 198 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A1W2PR64 198 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A1W2PRV1 198 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 ODAMA1E959 279 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 DPPA5A6NC42 116 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 CA11O75493 328 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 RBP4P02753 201 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF728P0DKX0 622 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 CHATP28329 748 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 GLIPR1P48060 266 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 TMBIM6P55061 237 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 DLX6P56179 175 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 VBP1P61758 197 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 AESQ08117 197 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF273Q14593 569 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 RAB12Q6IQ22 244 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 TCF23Q7RTU1 214 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 GAPTQ8N292 157 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 Q8N7P7 452 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 RAB2BQ8WUD1 216 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC25A46Q96AG3 418 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 HSF4Q9ULV5 492 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 SIGLEC9Q9Y336 463 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 ETV7Q9Y603 341 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A0A6YYD4 124 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A0B4J203 849 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 C17orf98A8MV24 154 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 HSPB6O14558 160 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 TSPAN9O75954 239 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 PAHP00439 452 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 FBP1P09467 338 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 CGB3P0DN86 165 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 CGB7P0DN87 165 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 SERPINB10P48595 397 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM50BP56557 158 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 IDNKQ5T6J7 187 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 C11orf87Q6NUJ2 197 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.06□□□□□ -1.28
CLSTN3-212ENST00000541770 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms