RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 OR10A7Q8NGE5 316 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 OR56B4Q8NH76 319 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 ARL11Q969Q4 196 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 MUL1Q969V5 352 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 BANF2Q9H503 90 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 IFT22Q9H7X7 185 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7.2□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 TMEM11P17152 192 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 RAB7AP51149 207 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 PAX5Q02548 391 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 DOC2BQ14184 412 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 MOB3BQ86TA1 216 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 PRR18Q8N4B5 295 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.19□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.19□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.19□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 ETAA1Q9NY74 926 aa7.19□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.18□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 ORC5O43913 435 aa7.18□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 IGKV1-33P01594 117 aa7.18□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 MT-ND4P03905 459 aa7.18□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 AMY2AP04746 511 aa7.18□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.18□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 PF4V1P10720 104 aa7.18□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 FSTP19883 344 aa7.18□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 CD33P20138 364 aa7.18□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 VHLP40337 213 aa7.18□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 CDH26Q8IXH8 852 aa7.18□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.18□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa7.17□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 H0YHG0 523 aa7.17□□□□□ -1.26
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LMO3-222ENST00000540445 SPINT2O43291 252 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 PF4P02776 101 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 CD1AP06126 327 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 CDK1P06493 297 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.17□□□□□ -1.26
LMO3-222ENST00000540445 MGMTP16455 207 aa7.17□□□□□ -1.26
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