RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GKN2Q86XP6 184 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM178AQ8NBL3 297 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLPP5Q8NEB5 264 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KLHDC9Q8NEP7 349 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR2T12Q8NG77 320 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR4C3Q8NH37 302 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR1L1Q8NH94 360 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MFSD8Q8NHS3 518 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RXFP2Q8WXD0 754 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SARAFQ96BY9 339 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DYNLL2Q96FJ2 89 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACY3Q96HD9 319 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM121Q9BTD3 319 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM59Q9BXS4 323 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MED28Q9H204 178 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ASIC5Q9NY37 505 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OARD1Q9Y530 152 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MYH4Q9Y623 1939 aa5.97□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A096LPK6 155 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GAGE12BA1L429 117 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C2CD4DB7Z1M9 353 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NDUFB4O95168 129 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CLDN14O95500 239 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SCTP09683 121 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AKAIN1P0CW23 69 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CT45A10P0DMU9 189 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TFPIP10646 304 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPL29P47914 159 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TFPI2P48307 235 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PTH2RP49190 550 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AQP4P55087 323 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SP4Q02446 784 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LTBQ06643 244 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ALG10BQ5I7T1 473 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GLYATL3Q5SZD4 288 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ALKAL1Q6UXT8 129 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BHLHA9Q7RTU4 235 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LINC01561Q8N1V8 128 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TEX45Q8NA69 505 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR11H6Q8NGC7 330 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR1S1Q8NH92 325 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZPLD1Q8TCW7 415 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BLNKQ8WV28 456 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RASL10AQ92737 203 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM106AQ96A25 262 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PHYHIPLQ96FC7 376 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PCED1BQ96HM7 432 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PGLYRP3Q96LB9 341 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLEKHF1Q96S99 279 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GPR21Q99679 349 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MCHR1Q99705 422 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KIR2DL4Q99706 377 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLA2G12BQ9BX93 195 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ULBP3Q9BZM4 244 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR2H1Q9GZK4 316 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM133Q9H2Q1 129 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 GLIPR2Q9H4G4 154 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 REEP1Q9H902 201 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FBXL12Q9NXK8 326 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TAS2R5Q9NYW4 299 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ANXA10Q9UJ72 324 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 VDAC3Q9Y277 283 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADGRB2O60241 1585 aa5.96□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ROBO3Q96MS0 1386 aa5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LRRC7Q96NW7 1537 aa5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A0G2JMM0 328 aa5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A0U1RQV1 116 aa5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A0A1W2PPB8 328 aa5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MSGN1A6NI15 193 aa5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IFITM10A6NMD0 228 aa5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LYRM9A8MSI8 78 aa5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF724A8MTY0 619 aa5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KIR3DP1A8MWS1 328 aa5.95□□□□□ -1.46
SOX9-AS1-211ENST00000533179 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms