RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 GPR35Q9HC97 309 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 CA10Q9NS85 328 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 OR6C6A6NF89 314 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 B9A039 149 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 K7ERU9 68 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 MFNGO00587 321 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 CHRM2P08172 466 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 HRH1P35367 487 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SCAND1P57086 179 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SNAI3Q3KNW1 292 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 ASB13Q8WXK3 278 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 PP6455Q8WZ26 134 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.81□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 AQP7O14520 342 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SOCS1O15524 211 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 RAD51DO75771 328 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 STAG3L2P0CL84 134 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 FSTP19883 344 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 PI3P19957 117 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 ATP1B3P54709 279 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 IL13RA1P78552 427 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 PSG4Q00888 419 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 UBE2V2Q15819 145 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SLC22A25Q6T423 547 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 STEAP2Q8NFT2 490 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 FDCSPQ8NFU4 85 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 FAM222BQ8WU58 562 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SEH1LQ96EE3 360 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 EHFQ9NZC4 300 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 PSG11Q9UQ72 335 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 ABCA4P78363 2273 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 GTF3C1Q12789 2109 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 DKK1O94907 266 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 OR5AC1P0C628 307 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 CTSSP25774 331 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 OPRM1P35372 400 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 CLDN18P56856 261 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 FXYD4P59646 89 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 ERVS71-1P61550 626 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 BRICD5Q6PL45 260 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 GGNQ86UU5 652 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM123Q8N131 208 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SLC35G3Q8N808 338 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SEC22AQ96IW7 307 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 TECTBQ96PL2 329 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 CDH20Q9HBT6 801 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 IGF2RP11717 2491 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.8□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 C5orf63A6NC05 138 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 M0QZ24 198 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 NME2P1O60361 137 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 HIST1H2BKO60814 126 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 RHBDL1O75783 438 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFB6O95139 128 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 HIST1H2BJP06899 126 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 HIST1H2BOP23527 126 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 CD34P28906 385 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 HIST1H2BBP33778 126 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 NPY4RP50391 375 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 HIST1H2BDP58876 126 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 HIST1H2BCP62807 126 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 OR5AS1Q8N127 324 aa6.79□□□□□ -1.32
TRPS1-208ENST00000519076 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.79□□□□□ -1.32
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