RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	HSPA12A	O43301	675 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SSSCA1	O60232	199 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	NRAS	P01111	189 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV1-13	P0DP09	117 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	GLI4	P10075	376 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC25A6	P12236	298 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	MYF5	P13349	255 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	TCN2	P20062	427 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	S100A2	P29034	98 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SST	P61278	116 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF92	Q03936	586 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	MALL	Q13021	153 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	OR8G1	Q15617	311 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	FRZB	Q92765	325 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	EXTL1	Q92935	676 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SLAMF9	Q96A28	289 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PFDN5	Q99471	154 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	IER2	Q9BTL4	223 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746		Q9N2K0	584 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746		U3KQA8	63 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CDH23	Q9H251	3354 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	OR5H1	A6NKK0	313 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1R2P9	O14990	202 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CHST1	O43916	411 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CST7	O76096	145 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	LY86	O95711	162 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	IFNA10	P01566	189 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	TRGC2	P03986	189 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	LCAT	P04180	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	THBD	P07204	575 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CCL3	P10147	92 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	BCL2	P10415	239 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF32	P17041	273 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	VDAC1	P21796	283 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	OMG	P23515	440 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CEACAM6	P40199	344 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	GFRA1	P56159	465 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CLDN15	P56746	228 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PKIA	P61925	76 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	VAMP2	P63027	116 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	PSG4	Q00888	419 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	RUNX1	Q01196	453 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFA6	Q01524	100 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	TLE4	Q04727	773 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF154	Q13106	437 aa		4.24	□□□□□ -1.73
ATXN3-212	ENST00000515746	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.24	□□□□□ -1.73

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