RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 UBALD1Q8TB05 177 aa13.35□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 ORAI1Q96D31 301 aa13.35□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 GPR61Q9BZJ8 451 aa13.35□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 METTL9Q9H1A3 318 aa13.35□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 IFT22Q9H7X7 185 aa13.35□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 TMEM138Q9NPI0 162 aa13.35□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 C15orf65H3BRN8 121 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 CCRL2O00421 344 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 CSTBP04080 98 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 SERPINA2P20848 420 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 MYCNOSP40205 109 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 ETV1P50549 477 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 PPP3R1P63098 170 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 EBI3Q14213 229 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 CCDC58Q4VC31 144 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 NHLRC3Q5JS37 347 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 ATAD3CQ5T2N8 411 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 OR2G6Q5TZ20 316 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 FOXRED2Q8IWF2 684 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 STPG2Q8N412 459 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 COMMD1Q8N668 190 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 CCDC107Q8WV48 283 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 ARL11Q969Q4 196 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 IL36GQ9NZH8 169 aa13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
HERC3-211ENST00000513325 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 SLC6A1P30531 599 aa13.33□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 ZNF695Q8IW36 515 aa13.33□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 OR52M1Q8NGK5 317 aa13.33□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 NEK7Q8TDX7 302 aa13.33□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 P2RX4Q99571 388 aa13.33□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 S100A13Q99584 98 aa13.33□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 MPV17LQ2QL34 196 aa13.32□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A6Q4U2R8 563 aa13.32□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 LINC00596Q86U02 117 aa13.32□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 C10orf67Q8IYJ2 551 aa13.32□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 LINC00311Q8N616 119 aa13.32□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 Q8N6K4 173 aa13.32□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 OR2T10Q8NGZ9 312 aa13.32□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 S100A14Q9HCY8 104 aa13.32□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 MT-ND4P03905 459 aa13.31□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 GPR12P47775 334 aa13.31□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 CD69Q07108 199 aa13.31□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 RIPK1Q13546 671 aa13.31□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 TEX38Q6PEX7 206 aa13.31□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa13.31□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 PQLC1Q8N2U9 271 aa13.31□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 Q8N9W7 124 aa13.31□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa13.31□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 ABCG5Q9H222 651 aa13.31□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 SLC31A2O15432 143 aa13.3□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 LALBAP00709 142 aa13.3□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa13.3□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa13.3□□□□□ -0.28
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HERC3-211ENST00000513325 LCNL1Q6ZST4 164 aa13.3□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 TMEM104Q8NE00 496 aa13.3□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 ZNF555Q8NEP9 628 aa13.3□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 GHSRQ92847 366 aa13.3□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 SMIM19Q96E16 107 aa13.3□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 RAX2Q96IS3 184 aa13.3□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 DCLRE1BQ9H816 532 aa13.3□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 PLSCR3Q9NRY6 295 aa13.3□□□□□ -0.28
HERC3-211ENST00000513325 CLEC2DQ9UHP7 191 aa13.3□□□□□ -0.28
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