RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	IL1A	P01583	271 aa		14.01	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	RAB3B	P20337	219 aa		14.01	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	CHAT	P28329	748 aa		14.01	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	RANBP1	P43487	201 aa		14.01	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		14.01	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		14.01	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		14.01	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIRREL1	Q96J84	757 aa		14.01	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	CYYR1	Q96J86	154 aa		14.01	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	CALY	Q9NYX4	217 aa		14.01	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	SSR3	Q9UNL2	185 aa		14.01	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A0A6YYD4	124 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	PAH	P00439	452 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGHV4-59	P01825	116 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	CD36	P16671	472 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	GZMH	P20718	246 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	OMG	P23515	440 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	GLP1R	P43220	463 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLDN12	P56749	244 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	AANAT	Q16613	207 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	C16orf87	Q6PH81	154 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	TPRA1	Q86W33	373 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	NEK7	Q8TDX7	302 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	DYRK2	Q92630	601 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	NICN1	Q9BSH3	213 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	CHIA	Q9BZP6	476 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		14	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	C15orf65	H3BRN8	121 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	AIP	O00170	330 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	ORC5	O43913	435 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLV1-47	P01700	117 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARG1	P05089	322 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	GADD45A	P24522	165 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	LGALS4	P56470	323 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	UTF1	Q5T230	341 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	HES5	Q5TA89	166 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	MALSU1	Q96EH3	234 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	ETAA1	Q9NY74	926 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	VGLL3	A8MV65	326 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	SSTR5	P35346	364 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	YIPF6	Q96EC8	236 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	KCTD7	Q96MP8	289 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	UBE2QL1	A1L167	161 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	NOTO	A8MTQ0	251 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMIM18	P0DKX4	95 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM50B	P56557	158 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR5R1	Q8NH85	324 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	RFESD	Q8TAC1	157 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF596	Q8TC21	504 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	CCDC107	Q8WV48	283 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	CENPO	Q9BU64	300 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	HSF4	Q9ULV5	492 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	POM121C	A8CG34	1229 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	F2RL2	O00254	374 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	SOCS1	O15524	211 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	PAX6	P26367	422 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	LOXL3	P58215	753 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	PLA2G7	Q13093	441 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR4K15	Q8NH41	348 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR9G1	Q8NH87	305 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	PIFO	Q8TCI5	191 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARL11	Q969Q4	196 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SH3BP2-223	ENST00000512131	PTX4	Q96A99	478 aa		13.96	□□□□□ -0.17

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