RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		1.01	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		1.01	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	LCT	P09848	1927 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	IGSF23	A1L1A6	192 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	NDUFS8	O00217	210 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	FGF16	O43320	207 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	CPM	P14384	443 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	GABRA3	P34903	492 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	AQP5	P55064	265 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	MP68	P56378	58 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	DEFA6	Q01524	100 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268		Q6ZT83	130 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	AHSA2	Q719I0	299 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268		A8MWP6	167 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	TMEM250	H0YL14	139 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	PSMD11	O00231	422 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	CDIPT	O14735	213 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	FABP7	O15540	132 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	RAB36	O95755	333 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	CRYGD	P07320	174 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	AKR1C4	P17516	323 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	MAGEA3	P43357	314 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	OR2B6	P58173	313 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	GABARAPL2	P60520	117 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	CD164	Q04900	197 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	OR8G1	Q15617	311 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	BSX	Q3C1V8	233 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268		Q6ZRU5	148 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	EBPL	Q9BY08	206 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	CCL26	Q9Y258	94 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	CACNA1S	Q13698	1873 aa		0.99	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	ABCB11	O95342	1321 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	OTOF	Q9HC10	1997 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268		A0A0J9YX75	114 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	ERICH4	A6NGS2	130 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268		B4DEV8	164 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	FNDC10	F2Z333	226 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	TRAPPC3	O43617	180 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	CDK14	O94921	469 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	SOX14	O95416	240 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	SNAP29	O95721	258 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	LTA	P01374	205 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	IGKV1D-12	P01611	117 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	OR4A8	P0C604	315 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	ACTR1B	P42025	376 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	INPP1	P49441	399 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	HTR4	Q13639	388 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	PCOTH	Q58A44	107 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	LRRC6	Q86X45	466 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	DTD1	Q8TEA8	209 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	GTF2H4	Q92759	462 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	MRAP2	Q96G30	205 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	CRB1	P82279	1406 aa		0.98	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	CEP170	Q5SW79	1584 aa		0.97	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		0.97	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		0.97	□□□□□ -2.25
USP34-222	ENST00000498268	KNCN	A6PVL3	124 aa		0.97	□□□□□ -2.25

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