RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		11.63	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	IGKV1D-33	P01593	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	IGKV1-33	P01594	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	REC114	Q7Z4M0	266 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	MOB3B	Q86TA1	216 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF329	Q86UD4	541 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	ARL11	Q969Q4	196 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	MUL1	Q969V5	352 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	CYYR1	Q96J86	154 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	IFT22	Q9H7X7	185 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	PSMB11	A5LHX3	300 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618		M0QZK8	103 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	HSD17B6	O14756	317 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	RAB7A	P51149	207 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	PAX5	Q02548	391 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	ST3GAL4	Q11206	333 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	DOC2B	Q14184	412 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618		Q499Y3	187 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	TTC23	Q5W5X9	447 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	OR14A2	Q96R54	314 aa		11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	C15orf65	H3BRN8	121 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	AIP	O00170	330 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	MAS1	P04201	325 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	GNAO1	P09471	354 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	GTF2F2	P13984	249 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	LOXL3	P58215	753 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	MED21	Q13503	144 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	RCN1	Q15293	331 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	MPV17L	Q2QL34	196 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	LINC00596	Q86U02	117 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	OR8H3	Q8N146	312 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	SETD9	Q8NE22	299 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	BANF2	Q9H503	90 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	CKLF	Q9UBR5	152 aa		11.6	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	LINC01548	A6NM66	108 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	SERPINE3	A8MV23	424 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	CCRL2	O00421	344 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC31A2	O15432	143 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	GPX5	O75715	221 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	MPIG6B	O95866	241 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	MT-ND4	P03905	459 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	GZMH	P20718	246 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	VHL	P40337	213 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	OR4K15	Q8NH41	348 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		11.59	□□□□□ -0.55
ATG4B-223	ENST00000493618	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	FST	P19883	344 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	SLC35A2	P78381	396 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	AWAT2	Q6E213	333 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	RAB12	Q6IQ22	244 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	AHSA2	Q719I0	299 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	STX19	Q8N4C7	294 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	ETAA1	Q9NY74	926 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		11.58	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	C12orf77	C9JDV5	145 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	MYL12B	O14950	172 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	FGF16	O43320	207 aa		11.57	□□□□□ -0.56
ATG4B-223	ENST00000493618	ORC5	O43913	435 aa		11.57	□□□□□ -0.56

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