RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 H0YIZ8 118 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SP1P08047 785 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 NPSP0C0P6 89 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 CALCRP30988 508 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RAB1AP62820 205 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 VHLLQ6RSH7 139 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ZNF611Q8N823 705 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 C10orf35Q96D05 121 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 LIME1Q9H400 295 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RASL12Q9NYN1 266 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 PRSS50Q9UI38 385 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 A0A0B4J2A0 478 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 AGPAT2O15120 278 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 MT-ND4LP03901 98 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ZNF708P17019 499 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 GPM6AP51674 278 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ARG2P78540 354 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 HIKESHIQ53FT3 197 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 PHLDA2Q53GA4 152 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 LHFPL1Q86WI0 220 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 OSR2Q8N2R0 312 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 KCNRGQ8N5I3 272 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 HS3ST6Q96QI5 342 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 OR2S2Q9NQN1 319 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 PARPBPQ9NWS1 579 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SHPKQ9UHJ6 478 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ANXA10Q9UJ72 324 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 STARD10Q9Y365 291 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ESPL1Q14674 2120 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PPH5 198 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 TCF21O43680 179 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 DAOP14920 347 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 GLP1RP43220 463 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 F2RL1P55085 397 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RBPJQ06330 500 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SLC10A1Q14973 349 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SPATA46Q5T0L3 261 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 FAM24BQ8N5W8 94 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 Q8NFD4 153 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 C20orf24Q9BUV8 137 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 IL36RNQ9UBH0 155 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 MSGN1A6NI15 193 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 F8VVB4 439 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 F8VWA3 439 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 WISP2O76076 250 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 OR2F2O95006 317 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 HLA-GP17693 338 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 CHATP28329 748 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 FUT6P51993 359 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 OR2F1Q13607 317 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RAB32Q13637 225 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A25Q6T423 547 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZSR3 168 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 GCNT2Q8N0V5 402 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 FAM169BQ8N8A8 192 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 NEK7Q8TDX7 302 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 RNF126Q9BV68 326 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 HRH4Q9H3N8 390 aa6□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 AKAP9Q99996 3911 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 CADP27708 2225 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 EREGO14944 169 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 BCL2L11O43521 198 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC4-211ENST00000492996 XRCC2O43543 280 aa5.99□□□□□ -1.45
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