RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCF23	Q7RTU1	214 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MKX	Q8IYA7	352 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FTMT	Q8N4E7	242 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR52I2	Q8NH67	350 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPX8	Q8TED1	209 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	AP3S1	Q92572	193 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	C14orf79	Q96F83	325 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	COQ2	Q96H96	371 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAFA1	Q96PS6	74 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSC22D3	Q99576	134 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM165	Q9HC07	324 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF7	Q9UBF6	113 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GHRL	Q9UBU3	117 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ITPR2	Q14571	2701 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FABP12	A6NFH5	140 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLDN25	C9JDP6	229 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	LGALS8	O00214	317 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIRPB1	O00241	398 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ORC5	O43913	435 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDCD6	O75340	191 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	NXPH2	O95156	264 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOSR1	O95249	250 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	HAND1	O96004	215 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV2-70	P01814	119 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GYPA	P02724	150 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPN	P16150	400 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	LMO1	P25800	156 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRDX2	P32119	198 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAPZA1	P52907	286 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP5C	P53041	499 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL13RA2	Q14627	380 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	AVPI1	Q5T686	147 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCL17	Q92583	94 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RDH5	Q92781	318 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNAPC3	Q92966	411 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB3C	Q96E17	227 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCL13	Q99616	98 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	NLK	Q9UBE8	527 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLK11	Q9UBX7	282 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	AK3	Q9UIJ7	227 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A096LNT2	108 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PQ09	198 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2AT4	A6NND4	320 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSPB6	O14558	160 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTDSPL	O15194	276 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	NAPSA	O96009	420 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF735	P0CB33	412 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CGB3	P0DN86	165 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CGB7	P0DN87	165 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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