RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489850.5

NOM1-208, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-208ENST00000489850 CHIAQ9BZP6 476 aa16.65■□□□□ 0.26
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NOM1-208ENST00000489850 H3BUX3 64 aa16.6■□□□□ 0.25
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NOM1-208ENST00000489850 PTX4Q96A99 478 aa16.59■□□□□ 0.25
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NOM1-208ENST00000489850 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
NOM1-208ENST00000489850 A0A0A6YYD4 124 aa16.58■□□□□ 0.24
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