RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 CD2P06729 351 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 SOX2P48431 317 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 KLHL22Q53GT1 634 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 TEX38Q6PEX7 206 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 MOB3BQ86TA1 216 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 LINC00596Q86U02 117 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF695Q8IW36 515 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 IZUMO1Q8IYV9 350 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 Q8N6K4 173 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 C8orf31Q8N9H6 132 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 GPR148Q8TDV2 347 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 METTL9Q9H1A3 318 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF581Q9P0T4 197 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 ING4Q9UNL4 249 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 TENM3Q9P273 2699 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 LINC01548A6NM66 108 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 AP4M1O00189 453 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 CDRT1O95170 752 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 CSTBP04080 98 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 RBM11P57052 281 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC58Q4VC31 144 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 OR2T10Q8NGZ9 312 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 OR52N1Q8NH53 320 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 ARL11Q969Q4 196 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM106AQ96A25 262 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 GON7Q9BXV9 100 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 ABCG5Q9H222 651 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 ORC5O43913 435 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 LIMS3P0CW19 117 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 LIMS4P0CW20 117 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 CD1BP29016 333 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 GPR12P47775 334 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 GP2P55259 537 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 MPV17LQ2QL34 196 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 Q3ZCU0 254 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 Q8N9W7 124 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 APH1BQ8WW43 257 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 C9orf16Q9BUW7 83 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM138Q9NPI0 162 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 GFOD1Q9NXC2 390 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 CCL24O00175 119 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 RAMP3O60896 148 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 REG1BP48304 166 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 PPP3R1P63098 170 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 DGCR2P98153 550 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 DDI2Q5TDH0 399 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 XAF1Q6GPH4 301 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF152Q8N8N0 203 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM104Q8NE00 496 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 RAX2Q96IS3 184 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 S100A13Q99584 98 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC29A1Q99808 456 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 DCLRE1BQ9H816 532 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP4-210ENST00000489601 MT-ND4P03905 459 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 ELANEP08246 267 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 SERPINA2P20848 420 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 IL3RAP26951 378 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 BDKRB2P30411 391 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 FOXE3Q13461 319 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 KIR2DS1Q14954 304 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 ATAD3CQ5T2N8 411 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF497Q6ZNH5 498 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 C10orf67Q8IYJ2 551 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC107Q8WV48 283 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 DUX3Q96PT4 197 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 PLSCR3Q9NRY6 295 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 RYR3Q15413 4870 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 OGG1O15527 345 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 TXNL1O43396 289 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 GPX5O75715 221 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 MOSP00540 346 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 GTF2F2P13984 249 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 DCKP27707 260 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 ZNF137PP52743 207 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 GPR50Q13585 617 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SH3BP4-210ENST00000489601 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.3 ms