RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487861.5

RAD51B-211, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 1,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-211ENST00000487861 MUC15Q8N387 334 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 PRR18Q8N4B5 295 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 TOMM40LQ969M1 308 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 KIRREL1Q96J84 757 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 DUX4Q9UBX2 424 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 KIF25Q9UIL4 384 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 C9orf170A2RU37 121 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 ZNF737O75373 536 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 C1QL1O75973 258 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 SIX6O95475 246 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 GYPAP02724 150 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 ZNF728P0DKX0 622 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 IRF2P14316 349 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 GLIPR1P48060 266 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 FAM209AQ5JX71 171 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 SLC35E4Q6ICL7 350 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 LIN54Q6MZP7 749 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 LYG2Q86SG7 212 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 FAM90A1Q86YD7 464 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 GAPTQ8N292 157 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 ZNF843Q8N446 348 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 FAM222BQ8WU58 562 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 ERGIC1Q969X5 290 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 MOB3AQ96BX8 217 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 DCTN5Q9BTE1 182 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 CHIAQ9BZP6 476 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 EGLN1Q9GZT9 426 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 PRR13Q9NZ81 148 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.81□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 A0A1W2PPR1 153 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 FAM172BPA6NC97 362 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 OOEPA6NGQ2 149 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 H7C1Q1 480 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 GOSR2O14653 212 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 PPYP01298 95 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 TK1P04183 234 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 RNF224P0DH78 156 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 ANXA3P12429 323 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 CD34P28906 385 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 TAS2R31P59538 309 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 HERV-K104P61576 105 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 IL13RA1P78552 427 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 HMGN3Q15651 99 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 ZFP69Q49AA0 526 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 STUMQ69YW2 141 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 OR1L1Q8NH94 360 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 CCL17Q92583 94 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 CCL13Q99616 98 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 MS4A5Q9H3V2 200 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.8□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.79□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 LRRC30A6NM36 301 aa6.79□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 C12orf77C9JDV5 145 aa6.79□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.79□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 TMEM178BH3BS89 294 aa6.79□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 K7N7A8 449 aa6.79□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 CCSO14618 274 aa6.79□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 SFT2D2O95562 160 aa6.79□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 LYNX1P0DP58 116 aa6.79□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 ECI1P42126 302 aa6.79□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 KCNJ3P48549 501 aa6.79□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 DHODHQ02127 395 aa6.79□□□□□ -1.32
RAD51B-211ENST00000487861 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms