RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 BABAM2Q9NXR7 383 aa16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PPE3 182 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PPI3 338 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 EBAG9O00559 213 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 HSD17B6O14756 317 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 FGF16O43320 207 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 GTF2F2P13984 249 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 NHLRC3Q5JS37 347 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 XAF1Q6GPH4 301 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 ZNF329Q86UD4 541 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 C5orf56Q8N8D9 126 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 ARL11Q969Q4 196 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 SMIM19Q96E16 107 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 IFT22Q9H7X7 185 aa16■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 NUDT19A8MXV4 375 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 CCRL2O00421 344 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 SLC22A6Q4U2R8 563 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 SLC35E3Q7Z769 313 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 SETD9Q8NE22 299 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 CCDC107Q8WV48 283 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 SPACA1Q9HBV2 294 aa15.99■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 OGG1O15527 345 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 WBP4O75554 376 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 DEFB121Q5J5C9 76 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 TTC23Q5W5X9 447 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 COMMD1Q8N668 190 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 OR52M1Q8NGK5 317 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 CYGBQ8WWM9 190 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 GHSRQ92847 366 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 TMEM80Q96HE8 168 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 ZFP57Q9NU63 452 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.98■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 MCRIP1C9JLW8 97 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 AIPO00170 330 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 ORC5O43913 435 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 REG1BP48304 166 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 YIF1BQ5BJH7 314 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 JAGN1Q8N5M9 183 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 OR2T10Q8NGZ9 312 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 GON7Q9BXV9 100 aa15.97■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 SLC6A1P30531 599 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 Q499Y3 187 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 LINC00527Q9UJ94 153 aa15.96■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
ACTB-212ENST00000484841 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 SPINT2O43291 252 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 C6orf183Q5T699 404 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 LINC00311Q8N616 119 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 OR13C5Q8NGS8 318 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 ORAI1Q96D31 301 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 GFOD1Q9NXC2 390 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 ZNF581Q9P0T4 197 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 GNG12Q9UBI6 72 aa15.95■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 IGHG2P01859 326 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 MT-ND4P03905 459 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 IGHV3-43DP0DP04 118 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 THBS3P49746 956 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 TAS2R43P59537 309 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 LRRC36Q1X8D7 754 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 AWAT2Q6E213 333 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 STPG2Q8N412 459 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 PRR18Q8N4B5 295 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 LINC00482Q8N8I6 264 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 ZFP41Q8N8Y5 198 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 C8orf31Q8N9H6 132 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 UBALD1Q8TB05 177 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 MUL1Q969V5 352 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 RASL11BQ9BPW5 248 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 C8orf4Q9NR00 106 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 ETAA1Q9NY74 926 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 CLEC2DQ9UHP7 191 aa15.94■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PP11 408 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 C15orf65H3BRN8 121 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 AP4M1O00189 453 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 TXNL1O43396 289 aa15.93■□□□□ 0.14
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