RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 HAAOP46952 286 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR3A4PP47883 348 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ATP1B3P54709 279 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 KISS1Q15726 138 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CNPY1Q3B7I2 92 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 FAM201AQ5SY85 155 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 AGAP6Q5VW22 663 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 UTS2BQ765I0 119 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 C11orf53Q8IXP5 236 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf174Q8IYL3 243 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 FTMTQ8N4E7 242 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF611Q8N823 705 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC54Q8NEL0 328 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 FAM46BQ96A09 425 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SLAMF9Q96A28 289 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 MICU1Q9BPX6 476 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CACNG6Q9BXT2 260 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 BARHL1Q9BZE3 327 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 NEK6Q9HC98 313 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM138Q9NPI0 162 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TUBG2Q9NRH3 451 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CBLN4Q9NTU7 201 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 C1orf123Q9NWV4 160 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 ZNF391Q9UJN7 358 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 FOXJ3Q9UPW0 622 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 GAB2Q9UQC2 676 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TCF19Q9Y242 345 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MPC1Q9Y5U8 109 aa3.92□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.91□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 DVL1O14640 695 aa3.91□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 GALP22466 123 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 PRKACBP22694 351 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 HTR2CP28335 458 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 NPBWR2P48146 333 aa3.91□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 EFNB2P52799 333 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CAPZA1P52907 286 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 ZNF154Q13106 437 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 RAB11BQ15907 218 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CARTPTQ16568 116 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 MOGQ16653 247 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 C2orf76Q3KRA6 126 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 SLC22A6Q4U2R8 563 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 GLT8D1Q68CQ7 371 aa3.91□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 TEX38Q6PEX7 206 aa3.91□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 DEFB108BQ8NET1 73 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR51D1Q8NGF3 324 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR5T2Q8NGG2 359 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR5A2Q8NGI9 324 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 OR51F2Q8NH61 342 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF671Q8TAW3 534 aa3.91□□□□□ -1.78
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PTPRC-211ENST00000484135 PHYHIPQ92561 330 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 CCL17Q92583 94 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRC-211ENST00000484135 YIPF5Q969M3 257 aa3.91□□□□□ -1.78
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