RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482054.1

CTSL-205, Transcript of cathepsin L, human

TSL 2

Gene CTSL, Length 908 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSL-205	ENST00000482054	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	ALG8	Q9BVK2	526 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	DHDH	Q9UQ10	334 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM212	A6NML5	194 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054		E9PI62	339 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	RAB3A	P20336	220 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	ECI1	P42126	302 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	FOXE3	Q13461	319 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	GPR50	Q13585	617 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	GALE	Q14376	348 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	KIR2DS1	Q14954	304 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	RSU1	Q15404	277 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF529	Q6P280	563 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	SATL1	Q86VE3	508 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	RNF152	Q8N8N0	203 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054		Q8NFD4	153 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	UBALD1	Q8TB05	177 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	ASCL2	Q99929	193 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	AASS	Q9UDR5	926 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	C15orf65	H3BRN8	121 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	MPZL2	O60487	215 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	CDRT1	O95170	752 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	HTR3B	O95264	441 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	ALPL	P05186	524 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	LYL1	P12980	280 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	CFHR3	Q02985	330 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	SYS1	Q8N2H4	156 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM104	Q8NE00	496 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	ARL11	Q969Q4	196 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	GON7	Q9BXV9	100 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	SCOC	Q9UIL1	159 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	EI24	O14681	340 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	MAGEB3	O15480	346 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	MOS	P00540	346 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	ELANE	P08246	267 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	GZMH	P20718	246 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	SOX2	P48431	317 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	ASCL4	Q6XD76	172 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	LINC00311	Q8N616	119 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	S1PR3	Q99500	378 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	IFT22	Q9H7X7	185 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	SNTN	A6NMZ2	147 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	IGHG4	P01861	327 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	CD1B	P29016	333 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	FHL3	Q13643	280 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	OR52N1	Q8NH53	320 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	CCDC107	Q8WV48	283 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	ING4	Q9UNL4	249 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CTSL-205	ENST00000482054	SLC31A2	O15432	143 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CTSL-205	ENST00000482054	ORC5	O43913	435 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CTSL-205	ENST00000482054	GABRB1	P18505	474 aa		10.08	□□□□□ -0.8

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