RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479788.5

DUSP28-204, Transcript of dual specificity phosphatase 28, human

TSL 3

Gene DUSP28, Length 450 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DUSP28-204	ENST00000479788	DEFA6	Q01524	100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	RIPK1	Q13546	671 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	PIGY	Q3MUY2	71 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788		Q499Y3	187 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	ELP2	Q6IA86	826 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	HEPN1	Q6WQI6	88 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	AHSA2	Q719I0	299 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	OR52N1	Q8NH53	320 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	GGH	Q92820	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	CORO2A	Q92828	525 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	GHSR	Q92847	366 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	SMIM19	Q96E16	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	COQ2	Q96H96	371 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	AKR1E2	Q96JD6	320 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	LALBA	P00709	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	MAS1	P04201	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	GNAO1	P09471	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	CEL	P19835	753 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	CD24	P25063	80 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	MNDA	P41218	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	GNG10	P50151	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	DYNLT3	P51808	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	WNT4	P56705	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	BDH1	Q02338	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	HES1	Q14469	280 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	TM4SF20	Q53R12	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	DMKN	Q6E0U4	476 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	ZNF529	Q6P280	563 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	LYG1	Q8N1E2	194 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	OR9G1	Q8NH87	305 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	RPE	Q96AT9	228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	SCN3B	Q9NY72	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788		A0A1W2PP11	408 aa		4.61	□□□□□ -1.67
DUSP28-204	ENST00000479788	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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