RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477458.1

DUSP11-204, Transcript of dual specificity phosphatase 11, human

TSL 5

Gene DUSP11, Length 588 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DUSP11-204	ENST00000477458	ACP1	P24666	158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	NPY4R	P50391	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	CLDN15	P56746	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	SGCA	Q16586	387 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	RAET1L	Q5VY80	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	ELP2	Q6IA86	826 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	INO80C	Q6PI98	192 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458		Q6ZS49	121 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	TMEM17	Q86X19	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	MR1	Q95460	341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	OR10C1	Q96KK4	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	C2orf50	Q96LR7	162 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	DKKL1	Q9UK85	242 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	NCKAP5	O14513	1909 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458		A6NLC8	198 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	LGALS8	O00214	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	SGCE	O43556	437 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	CYTIP	O60759	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	ADAP1	O75689	374 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	IGKV1D-12	P01611	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	SERPINA7	P05543	415 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	ZNF883	P0CG24	379 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	PGAM2	P15259	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	ZNF708	P17019	499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	ADCYAP1	P18509	176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	FUT6	P51993	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	PSMF1	Q92530	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	DCUN1D4	Q92564	292 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	GALNT14	Q96FL9	552 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	SMIM8	Q96KF7	97 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	GPER1	Q99527	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	LIME1	Q9H400	295 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	DEPP	Q9NTK1	212 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	HPF1	Q9NWY4	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	EHF	Q9NZC4	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
DUSP11-204	ENST00000477458	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms