RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466359.1

NFX1-205, Transcript of nuclear transcription factor, X-box binding 1, human

TSL 3

Gene NFX1, Length 391 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFX1-205	ENST00000466359	CDNF	Q49AH0	187 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	PECR	Q9BY49	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	NUP50	Q9UKX7	468 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359		A0A1W2PQ09	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	VGLL3	A8MV65	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	CLDN34	H7C241	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SPINT2	O43291	252 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	IGLV1-47	P01700	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	NAT1	P18440	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	FPR2	P25090	351 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	TGFBR1	P36897	503 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ETV6	P41212	452 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	KIR2DS4	P43632	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	DYNLT3	P51808	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	EDDM3B	P56851	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	LOXL3	P58215	753 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ARF6	P62330	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SCN1B	Q07699	218 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF273	Q14593	569 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	KIR2DS1	Q14954	304 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	HMGN3	Q15651	99 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	HCP5	Q6MZN7	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	DYRK2	Q92630	601 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	PHF21A	Q96BD5	680 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	KIRREL1	Q96J84	757 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SMR3A	Q99954	134 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	BEX2	Q9BXY8	128 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359		Q9N2K0	584 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NFX1-205	ENST00000466359		A0A0B4J203	849 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFX1-205	ENST00000466359	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFX1-205	ENST00000466359	TRDC	B7Z8K6	153 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFX1-205	ENST00000466359	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFX1-205	ENST00000466359	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFX1-205	ENST00000466359	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFX1-205	ENST00000466359	CTDSPL	O15194	276 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFX1-205	ENST00000466359	YPEL1	O60688	119 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFX1-205	ENST00000466359	RGS11	O94810	467 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFX1-205	ENST00000466359	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFX1-205	ENST00000466359	HLA-DQB1	P01920	261 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFX1-205	ENST00000466359	TFF1	P04155	84 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFX1-205	ENST00000466359	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
NFX1-205	ENST00000466359	CDK2	P24941	298 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NFX1-205	ENST00000466359	ZNF137P	P52743	207 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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