RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466141.1

RPUSD3-212, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 996 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-212ENST00000466141 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 XAF1Q6GPH4 301 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 NIT1Q86X76 327 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 ELOA3Q8NG57 546 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 OR10D3Q8NH80 312 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 PYURFQ96I23 114 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB40CQ96S21 281 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 SIRPDQ9H106 197 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 GCM1Q9NP62 436 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 RLIMQ9NVW2 624 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 CDH10Q9Y6N8 788 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 DSCAMO60469 2012 aa6.26□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 USF3Q68DE3 2245 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 OR5H1A6NKK0 313 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 AQP7P3A6NL99 342 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 G3V4G9 280 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 NME4O00746 187 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 TNFSF11O14788 317 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 PPP1R2P9O14990 202 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 TPST2O60704 377 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 TNFSF13O75888 250 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB36O95755 333 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 ISG15P05161 165 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 CST2P09228 141 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 IL7RP16871 459 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 CCKARP32238 428 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 SFTPDP35247 375 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 OR10A3P58181 314 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM27E3Q08E93 113 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 CLINT1Q14677 625 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB35Q15286 201 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 MORN2Q502X0 79 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 SYT14P1Q58G82 188 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 CD276Q5ZPR3 534 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 HBMQ6B0K9 141 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM225Q6GV28 225 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 OR4A47Q6IF82 309 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 TMUB2Q71RG4 321 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 ZNF440Q8IYI8 595 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 CBR4Q8N4T8 237 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 RNF128Q8TEB7 428 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 LHX4Q969G2 390 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 ORAI1Q96D31 301 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 SLC35E1Q96K37 410 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 SEC11CQ9BY50 192 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 MED28Q9H204 178 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 TMEM27Q9HBJ8 222 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 RAB22AQ9UL26 194 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 CR1P17927 2039 aa6.25□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 ABCA1O95477 2261 aa6.24□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.24□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 ANK2Q01484 3957 aa6.24□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 A8MVM7 634 aa6.24□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.24□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 CXCL13O43927 109 aa6.24□□□□□ -1.41
RPUSD3-212ENST00000466141 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms