RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431283.1

PTPN4-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-204	ENST00000431283	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	MED31	Q9Y3C7	131 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OR6C6	A6NF89	314 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF879	B4DU55	563 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	XKRY	O14609	159 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	NDUFA2	O43678	99 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OR5F1	O95221	314 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	PAH	P00439	452 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	IGHV1-69	P01742	117 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OPN1SW	P03999	348 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OPN1MW	P04001	364 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	THRB	P10828	461 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CFHR2	P36980	270 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TGFBR2	P37173	567 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF85	Q03923	595 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	FMOD	Q06828	376 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	AQP6	Q13520	282 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OR8B8	Q15620	311 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	DUSP7	Q16829	419 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF404	Q494X3	552 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	AGK	Q53H12	422 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SPRN	Q5BIV9	151 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF691	Q5VV52	312 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	C11orf88	Q6PI97	169 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283		Q6ZR03	302 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OAF	Q86UD1	273 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	COMTD1	Q86VU5	262 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OR5AS1	Q8N127	324 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OR8G5	Q8NG78	346 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM239	Q8WW34	195 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	LZIC	Q8WZA0	190 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	LHX4	Q969G2	390 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SH3GL1	Q99961	368 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC22A4	Q9H015	551 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	C16orf95	Q9H693	158 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	POLE4	Q9NR33	117 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	VAPA	Q9P0L0	249 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	AURKC	Q9UQB9	309 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	STARD10	Q9Y365	291 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	GMEB1	Q9Y692	573 aa		2.72	□□□□□ -1.97
PTPN4-204	ENST00000431283	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283		A0A0U1RQK1	487 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM120B	A0PK00	339 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283		F5H5P2	479 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283		G3V4G9	280 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	LGALS8	O00214	317 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	ANGPT2	O15123	496 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC16A7	O60669	478 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	HLA-DPB1	P04440	258 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	SFTPB	P07988	381 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	FBP1	P09467	338 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	IFI30	P13284	250 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	HTR1F	P30939	366 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC18A1	P54219	525 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	ARF6	P62330	175 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	VSNL1	P62760	191 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	ST3GAL3	Q11203	375 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	ECH1	Q13011	328 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	OR8G1	Q15617	311 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		2.71	□□□□□ -1.98
PTPN4-204	ENST00000431283	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		2.71	□□□□□ -1.98

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