RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 UFSP2Q9NUQ7 469 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 KCNK7Q9Y2U2 307 aa8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 A0A1W2PQ09 198 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 MEIOCA2RUB1 952 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM235A6NFC5 223 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 F5H0A9 414 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 GABARAPH6UMI1 98 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 PDCD6O75340 191 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 CA11O75493 328 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 LHBP01229 141 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 PRKACAP17612 351 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 GABRR1P24046 479 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 GUCA2AQ02747 115 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 HERPUD1Q15011 391 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF146Q15072 292 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 SPIN3Q5JUX0 258 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 STEAP3Q658P3 488 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 ACP7Q6ZNF0 438 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 LYG1Q8N1E2 194 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 Q8N402 240 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 GPX8Q8TED1 209 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 RAB3CQ96E17 227 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 PECRQ9BY49 303 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 WDR13Q9H1Z4 485 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 HSF4Q9ULV5 492 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 ANAPC10Q9UM13 185 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 NPTNQ9Y639 398 aa8.24□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 LANCL1O43813 399 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 SSX5O60225 188 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 NXPH2O95156 264 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 GNB3P16520 340 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 TNFRSF1AP19438 455 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 SNU13P55769 128 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 Q6P435 159 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 C6orf201Q7Z4U5 140 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 FAM90A1Q86YD7 464 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 OR52I2Q8NH67 350 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 SSMEM1Q8WWF3 244 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 SEH1LQ96EE3 360 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 EGLN1Q9GZT9 426 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 SCPEP1Q9HB40 452 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 ABCB10Q9NRK6 738 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 RASL12Q9NYN1 266 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF222Q9UK12 451 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 SERPINE3A8MV23 424 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 SULT1C2O00338 296 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 LPLP06858 475 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 CD3GP09693 182 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 IGLL1P15814 213 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 GLRA1P23415 457 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 GDNFP39905 211 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 IKZF1Q13422 519 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 ARL6IP1Q15041 203 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 ZMYND11Q15326 602 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 CDNFQ49AH0 187 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 ESCO2Q56NI9 601 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 HACD4Q5VWC8 232 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 TRIQKQ629K1 86 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 CHST4Q8NCG5 386 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 MUC7Q8TAX7 377 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 SULT4A1Q9BR01 284 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 RNF7Q9UBF6 113 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa8.22□□□□□ -1.09
ATG4B-211ENST00000429899 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-211ENST00000429899 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-211ENST00000429899 TSPAN9O75954 239 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-211ENST00000429899 OR2H2O95918 312 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-211ENST00000429899 HAND1O96004 215 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-211ENST00000429899 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-211ENST00000429899 FUT3P21217 361 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-211ENST00000429899 DUSP1P28562 367 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-211ENST00000429899 PRSS3P35030 304 aa8.21□□□□□ -1.1
ATG4B-211ENST00000429899 IER3P46695 156 aa8.21□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms