RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428450.5

DDX39B-209, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 4

Gene DDX39B, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-209ENST00000428450 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 MTCP1P56278 107 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 PSME3P61289 254 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 PRR20EP86478 221 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 PRR20CP86479 221 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 PRR20DP86480 221 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 PRR20BP86481 221 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 PRR20AP86496 221 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 MMDQ15546 238 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 MICAQ29983 383 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 ODF4Q2M2E3 257 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 RITA1Q96K30 269 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 EFCAB1Q9HAE3 211 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 PKD1P98161 4303 aa8.7□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 A0A1W2PN81 502 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 CCDC182A6NF36 153 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 H3BN98 237 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 SYT7O43581 403 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 SERPINA3P01011 423 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 CHRNA7P36544 502 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 MECP2P51608 486 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 NDPQ00604 133 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 PAX5Q02548 391 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 APOFQ13790 326 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 GINS1Q14691 196 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 LCN12Q6JVE5 192 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 CGB2Q6NT52 195 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 DEFB125Q8N687 156 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 C8orf31Q8N9H6 132 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 ANKRD60Q9BZ19 345 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 HSPB6O14558 160 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 CSN3P07498 182 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 MAGEA2P43356 314 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF137PP52743 207 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 CD81P60033 236 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 CXCR4P61073 352 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 ECSCRQ19T08 205 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 Q8N402 240 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 RFT1Q96AA3 541 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 NEURL2Q9BR09 285 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 SPAG4Q9NPE6 437 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 MYRFQ9Y2G1 1151 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.68□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 A0A0J9YWU9 116 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 H0YJX3 145 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 SLC31A2O15432 143 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 TXNL1O43396 289 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 TPPPO94811 219 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 CD7P09564 240 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 ACTBP60709 375 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 LSAMPQ13449 338 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 LIN54Q6MZP7 749 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 RDH10Q8IZV5 341 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 PP6455Q8WZ26 134 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 C10orf35Q96D05 121 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 NSMCE2Q96MF7 247 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 RHOFQ9HBH0 211 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 ETAA1Q9NY74 926 aa8.67□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 C15orf65H3BRN8 121 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 ARPC2O15144 300 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 ATP6V1G2O95670 118 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 HMGN1P05114 100 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 ATF1P18846 271 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 ZP3P21754 424 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 PRKACBP22694 351 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 IL3RAP26951 378 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF134P52741 427 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 ACTR3P61158 418 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 CDK5Q00535 292 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 TNFRSF9Q07011 255 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 LRRC36Q1X8D7 754 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
DDX39B-209ENST00000428450 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms