RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF83P51522 516 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF137PP52743 207 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 ONECUT1Q9UBC0 465 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 H3BVH4 76 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 MDH2P40926 338 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 FDX2Q6P4F2 183 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 SCGB1D4Q6XE38 83 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 PDPNQ86YL7 162 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 TRDCB7Z8K6 153 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 C21orf58P58505 322 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF345Q14585 488 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 PIGYQ3MUY2 71 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 MRGPRGQ86SM5 289 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 C5orf17Q8NAS9 161 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 ABHD3Q8WU67 409 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 SPOCK3Q9BQ16 436 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 OR5AC2Q9NZP5 309 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 C1QL1O75973 258 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 SKP2Q13309 424 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 OR10D3Q8NH80 312 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 ZPLD1Q8TCW7 415 aa12.72□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 HRKO00198 91 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 CYR61O00622 381 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 CCL4P13236 92 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 SLC35B1P78383 322 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 ZDHHC16Q969W1 377 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 FAM60AQ9NP50 221 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM167BQ9NRX6 74 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRU-204ENST00000428026 MELTFP08582 738 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 SEC11BP0C7V7 166 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 ZIC1Q15915 447 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 GABRA6Q16445 453 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 LYRM7Q5U5X0 104 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD37Q7Z713 158 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 OR4C12Q96R67 309 aa12.71□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 KLK2P20151 261 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 GZMMP51124 257 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 PSG6Q00889 435 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 SLC25A30Q5SVS4 291 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 PMS2CLQ68D20 193 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 LYZL6O75951 148 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 APCSP02743 223 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 MUC15Q8N387 334 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 ASXL3Q9C0F0 2248 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 MFSD2BA6NFX1 497 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 IFITM10A6NMD0 228 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 P01737 135 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 CDK2AP1O14519 115 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 DNAJC13O75165 2243 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 TRPM6Q9BX84 2022 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 HELTA6NFD8 242 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 TNFRSF1AP19438 455 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 COX7A1P24310 79 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 COMPP49747 757 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 OR4A47Q6IF82 309 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 OR4A4PQ8NGN8 299 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 RAB24Q969Q5 203 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 RPEQ96AT9 228 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 AP5S1Q9NUS5 200 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 OR6C3Q9NZP0 311 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa12.7□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 SIAH2O43255 324 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 ADAM11O75078 769 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 IGHV4-34P06331 123 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM50BP56557 158 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 A6NDN8 102 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF716A6NP11 495 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 COL8A1P27658 744 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 LINC00518Q8N0U6 118 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 HSPB9Q9BQS6 159 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 PSG2P11465 335 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 FCARP24071 287 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 GFRALQ6UXV0 394 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 LTBP1Q14766 1721 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 A0A1W2PN81 502 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 J3KRW8 73 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 PMELP40967 661 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 SGMS2Q8NHU3 365 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 CXorf65A6NEN9 183 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 RHBDL1O75783 438 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRU-204ENST00000428026 UQCRFS1P47985 274 aa12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms