RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 PITPNC1Q9UKF7 332 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ROS1P08922 2347 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SEMA7AO75326 666 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ORM1P02763 201 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 CRYBA1P05813 215 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SEC11BP0C7V7 166 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 PSG6Q00889 435 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 CD226Q15762 336 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 BHLHA9Q7RTU4 235 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC75AQ8NAA5 344 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.67□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 H3BQ15 152 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 CA11O75493 328 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SSPNQ14714 243 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 MESTQ5EB52 335 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 NPAS1Q99742 590 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ANGPTL4Q9BY76 406 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 FLRT3Q9NZU0 649 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 K7ESF4 209 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 FFAR1O14842 300 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 PAGE4O60829 102 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 MMP16P51512 607 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ZIC1Q15915 447 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 STXBP6Q8NFX7 210 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 C1RLQ9NZP8 487 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 NPTNQ9Y639 398 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00862A6NCI5 91 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SNURFLB1AK76 121 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 CDIPTO14735 213 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 IGF2P01344 180 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 BRS3P32247 399 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 DLX1P56177 255 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2M3Q8NG83 312 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 OR11H7Q8NGC8 314 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 RASL10BQ96S79 203 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC26A1Q9H2B4 701 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 A6NDN8 102 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 HELTA6NFD8 242 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 J3QT63 122 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 SMPD2O60906 423 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 C1QAP02745 245 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 CISD3P0C7P0 127 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 DRD3P35462 400 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 LGALS7P47929 136 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 MGAT2Q10469 447 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 DOLPP1Q86YN1 238 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 LHFPL5Q8TAF8 219 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ASB5Q8WWX0 329 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 MRGPRFQ96AM1 343 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 POM121Q96HA1 1249 aa9.66□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 OOEPA6NGQ2 149 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 HYAL1Q12794 435 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 LYZL2Q7Z4W2 148 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ASB10Q8WXI3 467 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 PERPQ96FX8 193 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 COX14Q96I36 57 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 TP53RKQ96S44 253 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 CHD7Q9P2D1 2997 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 LIPT2A6NK58 231 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 TMPRSS2O15393 492 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ACP1P24666 158 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 MPLP40238 635 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 D2HGDHQ8N465 521 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 WDR31Q8NA23 367 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 PARP11Q9NR21 331 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 VSIG4Q9Y279 399 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1W2PQD3 144 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF98A6NK75 572 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 K7ERU9 68 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 OR10J1P30954 320 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF788Q6ZQV5 615 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 TINAGQ9UJW2 476 aa9.65□□□□□ -0.86
EFTUD2-202ENST00000426333 NKX2-6A6NCS4 301 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms