RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 FUOMA2VDF0 154 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 C9J4A7 227 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 H7C2G1 150 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 UPK1AO00322 258 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 P4HA2O15460 535 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP8B1O43520 1251 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRKAB2O43741 272 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAMP3O60896 148 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLV3-27P01718 113 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 MT1HL1P0DM35 61 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRKACAP17612 351 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 FUT1P19526 365 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 CRHBPP24387 322 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 S100A2P29034 98 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 ALDH3A1P30838 453 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 GTF2H1P32780 548 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PFN2P35080 140 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAPAP54920 295 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNJ8Q15842 424 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 SSX1Q16384 188 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM41BQ5BJD5 291 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEX261Q6UWH6 196 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATAD1Q8NBU5 361 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR1F12Q8NHA8 337 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR51E1Q8TCB6 317 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PIBF1Q8WXW3 757 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 NAT6Q93015 286 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPM1MQ96MI6 270 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAS2R4Q9NYW5 299 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 COQ4Q9Y3A0 265 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIMM9Q9Y5J7 89 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 U3KQ87 197 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 NOS1P29475 1434 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 A6NDN8 102 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 GOSR2O14653 212 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUPR1O60356 82 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYCNOSP40205 109 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 CASP2P42575 452 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP5CP53041 499 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLEC12BQ2HXU8 276 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 GGTA1PQ4G0N0 100 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERPINA12Q8IW75 414 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00311Q8N616 119 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4P4Q8NGL7 312 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 THRSPQ92748 146 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 STMN2Q93045 179 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 YPEL4Q96NS1 127 aa-2.47□□□□□ -2.8
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RNU6-172P-201ENST00000411000 NIPAL2Q9H841 368 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa-2.47□□□□□ -2.8
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ACACAQ13085 2346 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYL12BO14950 172 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAD51CO43502 376 aa-2.48□□□□□ -2.81
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RNU6-172P-201ENST00000411000 FADS1O60427 444 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGHV1-69P01742 117 aa-2.48□□□□□ -2.81
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SRIP30626 198 aa-2.48□□□□□ -2.81
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ACLYP53396 1101 aa-2.48□□□□□ -2.81
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ACTBP60709 375 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 FGF12P61328 243 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACTG1P63261 375 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SCN1BQ07699 218 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP-2.48□□□□□ -2.81
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CLLU1OSQ5K130 101 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM74A1Q5RGS3 127 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAT1Q6PIZ9 186 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00596Q86U02 117 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF410Q86VK4 478 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 OOSP2Q86WS3 158 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00337Q8N6G1 96 aa-2.48□□□□□ -2.81
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