RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 ID3Q02535 119 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 FBXW9Q5XUX1 488 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 TMEM88Q6PEY1 159 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 GAPTQ8N292 157 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 SUMF2Q8NBJ7 301 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 CABLES2Q9BTV7 478 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 SCRT1Q9BWW7 348 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 ZNF175Q9Y473 711 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 ATMQ13315 3056 aa20.28■□□□□ 0.84
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PMS1-205ENST00000409985 BAXQ07812 192 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 SPIN3Q5JUX0 258 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 PCSK4Q6UW60 755 aa20.28■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 FAM58AQ8N1B3 248 aa20.28■□□□□ 0.84
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PMS1-205ENST00000409985 C19orf12Q9NSK7 152 aa20.28■□□□□ 0.84
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PMS1-205ENST00000409985 MIDNQ504T8 468 aa20.27■□□□□ 0.84
PMS1-205ENST00000409985 SHEQ5VZ18 495 aa20.27■□□□□ 0.84
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PMS1-205ENST00000409985 NEK7Q8TDX7 302 aa20.27■□□□□ 0.84
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PMS1-205ENST00000409985 Q8IYB0 196 aa20.26■□□□□ 0.83
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PMS1-205ENST00000409985 PBDC1Q9BVG4 233 aa20.26■□□□□ 0.83
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PMS1-205ENST00000409985 MLXQ9UH92 298 aa20.26■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 DEGS1O15121 323 aa20.26■□□□□ 0.83
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PMS1-205ENST00000409985 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 C9JQL5 133 aa20.25■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 IGKV1-13P0DP09 117 aa20.25■□□□□ 0.83
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PMS1-205ENST00000409985 EGLN1Q9GZT9 426 aa20.23■□□□□ 0.83
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PMS1-205ENST00000409985 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
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PMS1-205ENST00000409985 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa20.22■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa20.22■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 FREM1Q5H8C1 2179 aa20.22■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa20.22■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 FAM24AA6NFZ4 105 aa20.22■□□□□ 0.83
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