RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 LDLRAD3Q86YD5 345 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 ABHD12Q8N2K0 398 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF596Q8TC21 504 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 PTX4Q96A99 478 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 CREB3L1Q96BA8 519 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
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PGGT1B-202ENST00000379615 ESM1Q9NQ30 184 aa12.53□□□□□ -0.4
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNIP1Q9NZI2 227 aa12.53□□□□□ -0.4
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PGGT1B-202ENST00000379615 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 LDLRAD4O15165 306 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 SPINT2O43291 252 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 NFYBP25208 207 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 CD34P28906 385 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 AANATQ16613 207 aa12.52□□□□□ -0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa12.52□□□□□ -0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF554Q86TJ5 538 aa12.52□□□□□ -0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC107Q8WV48 283 aa12.52□□□□□ -0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 KCNK15Q9H427 330 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 DAPK2Q9UIK4 370 aa12.52□□□□□ -0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa12.52□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A087X0M5 115 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GX30 115 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 ODF3BA8MYP8 253 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 MMP23AO75900 390 aa12.51□□□□□ -0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 OMGP23515 440 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 HTR1DP28221 377 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 IER3P46695 156 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 MXD1Q05195 221 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 SFXN4Q6P4A7 337 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 Q6ZTK2 550 aa12.51□□□□□ -0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 NR2C2APQ86WQ0 139 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 OR13F1Q8NGS4 319 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 OR4K15Q8NH41 348 aa12.51□□□□□ -0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 RFESDQ8TAC1 157 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 DUX5Q96PT3 197 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNRD1Q9P1U0 126 aa12.51□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAV39A0A0B4J263 110 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM30A4D0T7 59 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 POM121CA8CG34 1229 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 SOCS1O15524 211 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 SCGNO76038 276 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 CRYBA1P05813 215 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM18P0DKX4 95 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 SSTR5P35346 364 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 CEACAM3P40198 252 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 VEGFCP49767 419 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGDIBP52566 201 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 SCAND1P57086 179 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 ARL6IP1Q15041 203 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 C16orf87Q6PH81 154 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 OR52M1Q8NGK5 317 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 OR9G1Q8NH87 305 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 NDNFQ8TB73 568 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 DYRK2Q92630 601 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB3CQ96E17 227 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 SULT4A1Q9BR01 284 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 C19orf24Q9BVV8 132 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 FUNDC2Q9BWH2 189 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 MEGF9Q9H1U4 602 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 FBN3Q75N90 2809 aa12.5□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 ACTG1P63261 375 aa12.49□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 LTC4SQ16873 150 aa12.49□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 MOB1BQ7L9L4 216 aa12.49□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 ATG5Q9H1Y0 275 aa12.49□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF167Q9H6Y7 350 aa12.49□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 ABRACLQ9P1F3 81 aa12.49□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 DPM3Q9P2X0 92 aa12.49□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 MGAT4AQ9UM21 535 aa12.49□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0A6YYD4 124 aa12.48□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A0B4J203 849 aa12.48□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 LEUTXA8MZ59 168 aa12.48□□□□□ -0.41
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