RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365430.1

RNU6-487P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 487, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-487P, Length 104 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-487P-201ENST00000365430 KCTD4Q8WVF5 259 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C15orf41Q9Y2V0 281 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KIAA0232Q92628 1395 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SHANK1Q9Y566 2161 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATRNO75882 1429 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTPRKQ15262 1439 aa1.31□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C4orf51C9J302 202 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C15orf65H3BRN8 121 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LECT2O14960 151 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PET100P0DJ07 73 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PTHLHP12272 177 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 AKR1C4P17516 323 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ORM2P19652 201 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CRABP2P29373 138 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 GABRA3P34903 492 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CRATP43155 626 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACTBP60709 375 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ACTG1P63261 375 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 BSPH1Q075Z2 132 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SMAGPQ0VAQ4 97 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TSPAN31Q12999 210 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DHRS2Q13268 280 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SKP2Q13309 424 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 APOFQ13790 326 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGFBP7Q16270 282 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PYDC2Q56P42 97 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SPIN3Q5JUX0 258 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SCXQ7RTU7 201 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRP11Q86VZ4 500 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM75Q8N9X5 138 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LFNGQ8NES3 379 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LMX1AQ8TE12 382 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF251Q9BRH9 671 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CHST5Q9GZS9 411 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ARL6Q9H0F7 186 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 WDR54Q9H977 334 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ASF1BQ9NVP2 202 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 SLC23A2Q9UGH3 650 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 NID2Q14112 1375 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 NOS1P29475 1434 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DYSFO75923 2080 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 MYO15BQ96JP2 1530 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CACNA1DQ01668 2161 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 GMNCA6NCL1 334 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 GOLGA6L10A6NI86 522 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 GGTLC3B5MD39 225 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 F5H5T6 163 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM250H0YL14 139 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CETN3O15182 167 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CRXO43186 299 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 POP7O75817 140 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CBR3O75828 277 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 GPR75O95800 540 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LTAP01374 205 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 IGHV3-53P01767 116 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ORM1P02763 201 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 P0C880 135 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ATF1P18846 271 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CXCL2P19875 107 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CXCL3P19876 107 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 RCVRNP35243 200 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 HSPA13P48723 471 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 NUDT2P50583 147 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 KRTAP10-1P60331 282 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 FAM3AP98173 230 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 C1DQ13901 141 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 BRD3OSQ6XYD6 125 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PAGE2Q7Z2X7 111 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 VN1R4Q7Z5H5 301 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 HS3ST5Q8IZT8 346 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PACRGLQ8N7B6 248 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 OR4P4Q8NGL7 312 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CASTOR1Q8WTX7 329 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 CLDN23Q96B33 292 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PPCDCQ96CD2 204 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LRRC45Q96CN5 670 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 HBEGFQ99075 208 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TMEM208Q9BTX3 173 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 DUSP21Q9H596 190 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 ZNF286AQ9HBT8 521 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 LINC00588Q9Y4M8 146 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-487P-201ENST00000365430 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms