RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 DANCRP0C864 163 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 LIMS3P0CW19 117 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 LIMS4P0CW20 117 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 AKR1C4P17516 323 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf68Q2NKX9 166 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 PHLDA2Q53GA4 152 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 FAM90A1Q86YD7 464 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 OR13F1Q8NGS4 319 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ISOC1Q96CN7 298 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 OR51E2Q9H255 320 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 PRDM13Q9H4Q3 707 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CALYQ9NYX4 217 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ATPIF1Q9UII2 106 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 RAB22AQ9UL26 194 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 MED12LQ86YW9 2145 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa3.72□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 OR2H2O95918 312 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV1-69P01742 117 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 TRGV3P03979 118 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF250P15622 560 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 PAX6P26367 422 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 KCNJ3P48549 501 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 ACSM1Q08AH1 577 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 SHISA2Q6UWI4 295 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 LCNL1Q6ZST4 164 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 SYS1Q8N2H4 156 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 FAM169BQ8N8A8 192 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 OR52N4Q8NGI2 321 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 OR10Z1Q8NGY1 313 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 HARBI1Q96MB7 349 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 FKBP14Q9NWM8 211 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 EXTL2Q9UBQ6 330 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 CEPT1Q9Y6K0 416 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PN81 502 aa3.71□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 M0QZK8 103 aa3.71□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 GPR137BO60478 399 aa3.71□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 PDCD6O75340 191 aa3.71□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 HRASP01112 189 aa3.71□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 CHRNA7P36544 502 aa3.71□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 ITPKCQ96DU7 683 aa3.71□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 AMELYQ99218 206 aa3.71□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.81
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.81
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PTPRC-201ENST00000348564 ZFPL1O95159 310 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV4-59P01825 116 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RBP4P02753 201 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 HTN1P15515 57 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SRMP19623 302 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 P2RX3P56373 397 aa3.71□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 KPTNQ9Y664 436 aa3.71□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 NPIPB4C9JG80 1138 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 AP4M1O00189 453 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 FABP7O15540 132 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 KRASP01116 189 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IGHA1P01876 353 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TTRP02766 147 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV4-31P0DP07 118 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 S100A10P60903 97 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF85Q03923 595 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RAB31Q13636 194 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PIGYQ3MUY2 71 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ACTBL2Q562R1 376 aa3.71□□□□□ -1.82
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