RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 CNIH2Q6PI25 160 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 FAM131AQ6UXB0 335 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 ZNF101Q8IZC7 436 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 STEAP2Q8NFT2 490 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 OR56B1Q8NGI3 324 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 C14orf79Q96F83 325 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 SORCS2Q96PQ0 1159 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 M0QXV9 152 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 AP4M1O00189 453 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 CCL21O00585 134 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 GGCTO75223 188 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 ALDOBP05062 364 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 MAS1LP35410 378 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 MMP15P51511 669 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 UBE2V2Q15819 145 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 OR52W1Q6IF63 320 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 PRR27Q6MZM9 219 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 S100A13Q99584 98 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 PRRT1Q99946 306 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 ETV7Q9Y603 341 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 SHANK1Q9Y566 2161 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 TMEM218A2RU14 115 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 C5orf52A6NGY3 159 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
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CCR6-201ENST00000341935 SNAPC5O75971 98 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 YIF1AO95070 293 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 TCRBP04435 133 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 CECR9P0C854 216 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 ERVFRD-1P60508 538 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 PITPNAQ00169 270 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 KCNIP4Q6PIL6 250 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 BTNL3Q6UXE8 466 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 BATF2Q8N1L9 274 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 SSC4DQ8WTU2 575 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 FAM3DQ96BQ1 224 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 SOSTQ9BQB4 213 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 ARV1Q9H2C2 271 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 PLK3Q9H4B4 646 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 CYSLTR2Q9NS75 346 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 CBLN4Q9NTU7 201 aa5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 OR14J1Q9UGF5 321 aa5.19□□□□□ -1.58
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CCR6-201ENST00000341935 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa5.18□□□□□ -1.58
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CCR6-201ENST00000341935 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 ZNF83P51522 516 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 UCP2P55851 309 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 TMEM33P57088 247 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 CKS1BP61024 79 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 PPP1CBP62140 327 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 ZNF79Q15937 498 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 HAGHQ16775 308 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 TMEM42Q69YG0 159 aa5.18□□□□□ -1.58
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CCR6-201ENST00000341935 OR51D1Q8NGF3 324 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 MUCL1Q96DR8 90 aa5.18□□□□□ -1.58
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CCR6-201ENST00000341935 CXorf58Q96LI9 332 aa5.18□□□□□ -1.58
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CCR6-201ENST00000341935 TP53RKQ96S44 253 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 KCNK15Q9H427 330 aa5.18□□□□□ -1.58
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CCR6-201ENST00000341935 M0R1B8 84 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 NRASP01111 189 aa5.18□□□□□ -1.58
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CCR6-201ENST00000341935 FGF7P21781 194 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 CALCRP30988 508 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 CCKARP32238 428 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 SORDQ00796 357 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 PRSS57Q6UWY2 283 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.18□□□□□ -1.58
CCR6-201ENST00000341935 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.18□□□□□ -1.58
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