RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324545.8

USP9X-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 9 X-linked, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP9X, Length 12,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9X-201ENST00000324545 PIGYQ3MUY2 71 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 TYMSP04818 313 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ZNF415Q09FC8 603 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ALG14Q96F25 216 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ATF1P18846 271 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ARF6P62330 175 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ZNF384Q8TF68 577 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ZNF488Q96MN9 340 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 LINC00303Q3SY05 128 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ATG101Q9BSB4 218 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ZNF793Q6ZN11 406 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 MCHR2Q969V1 340 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 GPR35Q9HC97 309 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 FGF2P09038 288 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 CTF1Q16619 201 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 PMS2CLQ68D20 193 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 MRAPQ8TCY5 172 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 FGF22Q9HCT0 170 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 TMEM160Q9NX00 188 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 FZD9O00144 591 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ASCL4Q6XD76 172 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 C18orf15Q96N68 181 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ZNF426Q9BUY5 554 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 FAM157CP0CG43 387 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 SLC35E2P0CK97 266 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 EFNB1P98172 346 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.62□□□□□ -1.35
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USP9X-201ENST00000324545 SSTR5P35346 364 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 NUBPLQ8TB37 319 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 CLDN18P56856 261 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 OR2A5Q96R48 311 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ANXA10Q9UJ72 324 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 NOTCH4Q99466 2003 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 A0A1W2PN81 502 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 CORTO00230 105 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 DNAL4O96015 105 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 SLC6A1P30531 599 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 RING1Q06587 406 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 KCNMB2Q9Y691 235 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 KLF4O43474 513 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 FECHP22830 423 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 PGFP49763 221 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 LAMB2P55268 1798 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 BCL2L11O43521 198 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 GHITMQ9H3K2 345 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 ZNF487B1APH4 448 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 SLC25A17O43808 307 aa6.62□□□□□ -1.35
USP9X-201ENST00000324545 MPDU1O75352 247 aa6.62□□□□□ -1.35
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