RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.71□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 KPTNQ9Y664 436 aa11.71□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 LRP5LA4QPB2 252 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 IGHG3P01860 377 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 CA6P23280 308 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 FHITP49789 147 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 HMGN3Q15651 99 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 SPIN3Q5JUX0 258 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 OR8G5Q8NG78 346 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 GPHA2Q96T91 129 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 GLRX2Q9NS18 164 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 HSD17B6O14756 317 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 NFYBP25208 207 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 PAX9P55771 341 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 BAXQ07812 192 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF266Q14584 549 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF497Q6ZNH5 498 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 MOB1BQ7L9L4 216 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 CACNA1GO43497 2377 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 AGPAT2O15120 278 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 TSPAN15O95858 294 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 CMTM1Q8IZ96 169 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 EGLN1Q9GZT9 426 aa11.7□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 GPR179Q6PRD1 2367 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 C3orf80F5H4A9 247 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 CELA3BP08861 270 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 IGHV1-2P23083 117 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 TNFSF10P50591 281 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF146Q15072 292 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 GUK1Q16774 197 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 Q8IYB0 196 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM178AQ8NBL3 297 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 OR10Z1Q8NGY1 313 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 NEK7Q8TDX7 302 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 RDH5Q92781 318 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 RTL8AQ9BWD3 113 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM9BQ9NQ34 198 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 PRELID1Q9Y255 219 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 A0A0G2JRQ6 117 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 ARGFXA6NJG6 315 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 IQCF6A8MYZ5 107 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 HS3ST1O14792 307 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 SSSCA1O60232 199 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 C1QL1O75973 258 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 PGA5P0DJD9 388 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 CEACAM1P13688 526 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 CAMLGP49069 296 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 TESK1Q15569 626 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 SCCPDHQ8NBX0 429 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 OR10J5Q8NHC4 309 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 AKR1E2Q96JD6 320 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 SLC25A31Q9H0C2 315 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 HES4Q9HCC6 221 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 WIPI2Q9Y4P8 454 aa11.69□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 A0A1W2PR80 420 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 COLCA2A8K830 154 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 CDRT15L2A8MXV6 281 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 H7C2Y5 167 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 FOLR2P14207 255 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 ATP6V0CP27449 155 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 CD82P27701 267 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 OR8G1Q15617 311 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 IGFBP7Q16270 282 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 IL22RA1Q8N6P7 574 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 SUMF1Q8NBK3 374 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 PEA15Q15121 130 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 IGFL2Q6UWQ7 119 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 LFNGQ8NES3 379 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 R4GN57 208 aa11.68□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 BDP1A6H8Y1 2624 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 OR2H2O95918 312 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 IGKV1-39P01597 117 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 IGKV1D-39P04432 117 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 PPP1CBP62140 327 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 ARG2P78540 354 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 GABRA6Q16445 453 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 SPATA46Q5T0L3 261 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 OR10V1Q8NGI7 309 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 OR51B6Q9H340 312 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 SMDT1Q9H4I9 107 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 OR1A1Q9P1Q5 309 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 KNTC1P50748 2209 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 A0A1B0GU03 582 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 UMAD1C9J7I0 102 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 RAC2P15153 192 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 SPINK2P20155 84 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF616Q08AN1 781 aa11.67□□□□□ -0.54
ATG4C-201ENST00000317868 SPSB3Q6PJ21 355 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.4 ms