RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300648.6

GCN1-201, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GCN1, Length 8,675 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1-201ENST00000300648 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.98□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 ELOVL1Q9BW60 279 aa9.98□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 CHST5Q9GZS9 411 aa9.98□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 CYR61O00622 381 aa9.98□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 PLPP3O14495 311 aa9.98□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 GNG7O60262 68 aa9.98□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 GHRHP01286 108 aa9.98□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa9.98□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 SYT8Q8NBV8 401 aa9.98□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 RLN3Q8WXF3 142 aa9.98□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 VN1R17PQ8TDU5 208 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 PPP1R17O96001 155 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 SRD5A2P31213 254 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 PSG5Q15238 335 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 TMEM30BQ3MIR4 351 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 FAM209AQ5JX71 171 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 SFTPCP11686 197 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 GABRG2P18507 467 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 OR3A4PP47883 348 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 LYZP61626 148 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 ZNF273Q14593 569 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 ANKRD10Q9NXR5 420 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 RAC3P60763 192 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 GABRA6Q16445 453 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 GPBAR1Q8TDU6 330 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 ASB10Q8WXI3 467 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 CLEC1BQ9P126 229 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 GBF1Q92538 1859 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 ATRXP46100 2492 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 LIPFP07098 398 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 TUSC5Q8IXB3 177 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 TBX15Q96SF7 602 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 LOXL2Q9Y4K0 774 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 KCNE3Q9Y6H6 103 aa9.97□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 ZNF117Q03924 483 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 SKP2Q13309 424 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 TMEM255AQ5JRV8 349 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 ZNF788Q6ZQV5 615 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 NPTNQ9Y639 398 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 ADIPOQQ15848 244 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 WDR13Q9H1Z4 485 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 TAF1LQ8IZX4 1826 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 TNFSF10P50591 281 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 WNT3P56703 355 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 CBLN2Q8IUK8 224 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 STPG3Q8N7X2 389 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 WNT16Q9UBV4 365 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 DHRS7CA6NNS2 312 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 IFI6P09912 130 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 NCMAPQ5T1S8 102 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 SLC25A34Q6PIV7 304 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 SGMS2Q8NHU3 365 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 GHITMQ9H3K2 345 aa9.96□□□□□ -0.81
GCN1-201ENST00000300648 ZNF236Q9UL36 1845 aa9.96□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 FAM157CP0CG43 387 aa9.96□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 FOLR2P14207 255 aa9.96□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 SELENOPP49908 381 aa9.96□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.96□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 DOK5Q9P104 306 aa9.96□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 IL17BQ9UHF5 180 aa9.96□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.96□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.96□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 SPATA45Q537H7 98 aa9.96□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 RAB1CQ92928 201 aa9.96□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 MEGF10Q96KG7 1140 aa9.96□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 FCARP24071 287 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 IER3P46695 156 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 SPNS3Q6ZMD2 512 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 BTLAQ7Z6A9 289 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 TM4SF19Q96DZ7 209 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 NPIPB8E9PQR5 432 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 H0Y980 276 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 PPM1DO15297 605 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 ADAP1O75689 374 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 ARG1P05089 322 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 ORM2P19652 201 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 FAM216AQ8WUB2 273 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 RSRP1Q9BUV0 290 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 ASB1Q9Y576 335 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 CHST1O43916 411 aa9.95□□□□□ -0.82
GCN1-201ENST00000300648 CALHM1Q8IU99 346 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms