RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.02□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.02□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 TMEM104Q8NE00 496 aa8.02□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 OR51T1Q8NGJ9 327 aa8.02□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 FEVQ99581 238 aa8.02□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 APOL4Q9BPW4 351 aa8.02□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 BARHL1Q9BZE3 327 aa8.02□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.02□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ING3Q9NXR8 418 aa8.02□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 STUB1Q9UNE7 303 aa8.02□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 MEIKINA0A087WXM9 373 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 FAM90A10PA6NDY2 464 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 GNGT2O14610 69 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 DEGS1O15121 323 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 TXNL1O43396 289 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 LY6G6CO95867 125 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 CST1P01037 141 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 IGLV1-51P01701 117 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 IL3RAP26951 378 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 REG1BP48304 166 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ALDH3A2P51648 485 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 LRRC36Q1X8D7 754 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 AMIGO2Q86SJ2 522 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 LINC00311Q8N616 119 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 GIPC3Q8TF64 312 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 SPSB1Q96BD6 273 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 CIB1Q99828 191 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 TUBA4BQ9H853 241 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 OAZ3Q9UMX2 235 aa8.01□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 CCDC182A6NF36 153 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 C12orf77C9JDV5 145 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 H0Y980 276 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 OSMP13725 252 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ATF1P18846 271 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 F2RL1P55085 397 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 PAX5Q02548 391 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 LTC4SQ16873 150 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ODF4Q2M2E3 257 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 UTS2BQ765I0 119 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 SAXO1Q8IYX7 474 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 YIPF7Q8N8F6 280 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 C8orf31Q8N9H6 132 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 BATF3Q9NR55 127 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ENOPH1Q9UHY7 261 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 KIF25Q9UIL4 384 aa8□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 A0A087WW49 117 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 TRAV41A0A0B4J266 112 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 A0A1W2PPE3 182 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 G3V2T6 193 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 G3V318 75 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 EI24O14681 340 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 APOL3O95236 402 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 IGKV1D-12P01611 117 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 KRT8P05787 483 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 KCNJ3P48549 501 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 RNLSQ5VYX0 342 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 SLC35F2Q8IXU6 374 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 CBR4Q8N4T8 237 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 MINDY2Q8NBR6 621 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 RFESDQ8TAC1 157 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 OPALINQ96PE5 141 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 MBOAT4Q96T53 435 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 TMED9Q9BVK6 235 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 HIPK2Q9H2X6 1198 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ZNF556Q9HAH1 456 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 SLC25A19Q9HC21 320 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 FAM118AQ9NWS6 357 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 CLN6Q9NWW5 311 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ORC6Q9Y5N6 252 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.99□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ATP6V0E1O15342 81 aa7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 RPP14O95059 124 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 HLA-DRB1P01911 266 aa7.98□□□□□ -1.13
USP41-201ENST00000292729 ALPLP05186 524 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms