RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263434.5

PTPRH-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type H, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRH, Length 3,343 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRH-201ENST00000263434 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 CEBPZOSA8MTT3 80 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 CD200P41217 278 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 BEND4Q6ZU67 534 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 DNASE2BQ8WZ79 361 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 SNX22Q96L94 193 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 PLK3Q9H4B4 646 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 U3KQA8 63 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 NCKAP5O14513 1909 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 PATE3B3GLJ2 98 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 TRAPPC2LH3BP13 241 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 PPP1R2P9O14990 202 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 CXCL12P48061 93 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 ARF1P84077 181 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 TLE4Q04727 773 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 IMMP1LQ96LU5 166 aa13.16□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 CLDND2Q8NHS1 167 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 CPT1CQ8TCG5 803 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 SCGB1C1Q8TD33 95 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 Q9N2K0 584 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 RPRMQ9NS64 109 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 MTCH1Q9NZJ7 389 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF716A6NP11 495 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 VDAC1P21796 283 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 UCP3P55916 312 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 DEFA6Q01524 100 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF787Q6DD87 383 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 OR8G2PQ6IF36 304 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 FRZBQ92765 325 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 GPR146Q96CH1 333 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 TAAR3PQ9P1P4 343 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 CACNG5Q9UF02 275 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRH-201ENST00000263434 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 TRGC1P0CF51 173 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 STARD6P59095 220 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 SRPXP78539 464 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 SPANXN5Q5MJ07 72 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 LYSMD4Q5XG99 296 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 OR1A1Q9P1Q5 309 aa13.15□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 GTF3C1Q12789 2109 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 GJE1A6NN92 205 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 LILRA1O75019 489 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 PGA5P0DJD9 388 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 HLA-DRB3P79483 266 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 TESK1Q15569 626 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM42Q69YG0 159 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 SPINK14Q6IE38 97 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 Q6ZRM9 215 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 GGNQ86UU5 652 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 LILRB2Q8N423 598 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 FAM210BQ96KR6 192 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 ATP5SQ99766 215 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 PRR14LQ5THK1 2151 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 WDR1O75083 606 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 BMP5P22003 454 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 GAMTQ14353 236 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 KHDC3LQ587J8 217 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 MKXQ8IYA7 352 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 PSMF1Q92530 271 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 PINLYPA6NC86 204 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 PAX9P55771 341 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 ADIRFQ15847 76 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 C3AR1Q16581 482 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 SSX7Q7RTT5 188 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 AGBL5Q8NDL9 886 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 MALSU1Q96EH3 234 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 PRRG4Q9BZD6 226 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 SLC34A2O95436 690 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 PMELP40967 661 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 FOLR3P41439 243 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 NMSQ5H8A3 153 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 ASCL4Q6XD76 172 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 OR2V1Q8NHB1 315 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM56Q96MV1 263 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 DUSP23Q9BVJ7 150 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 DEPPQ9NTK1 212 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 CELA3AP09093 270 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 LMO1P25800 156 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 EXT1Q16394 746 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 MEGF10Q96KG7 1140 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 YPEL4Q96NS1 127 aa13.13□□□□□ -0.31
PTPRH-201ENST00000263434 UFSP2Q9NUQ7 469 aa13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms