RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 AWAT1Q58HT5 328 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 C22orf34Q6ZV56 151 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM219AQ8IW50 185 aa22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 MAS1LP35410 378 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 SCRT1Q9BWW7 348 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL9Q9H1A3 318 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNA1DQ01668 2161 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCA4P78363 2273 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 CCKARP32238 428 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 CAMLGP49069 296 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5D18Q8NGL1 313 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 MAFIPQ8WZ33 124 aa22.49■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 SGCEO43556 437 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 MBPP02686 304 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF728P0DKX0 622 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 LMO1P25800 156 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM187Q14656 261 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCA11PQ4W5N1 156 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC01560Q8TB33 94 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 SYT3Q9BQG1 590 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35B3Q9H1N7 401 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 C19orf12Q9NSK7 152 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGLQ9Y2B2 252 aa22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 GLAP06280 429 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB5AP20339 215 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP1P28562 367 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 CSNK1A1P48729 337 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 PIGPP57054 158 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 C6orf201Q7Z4U5 140 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM54Q969K7 222 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 SPTSSAQ969W0 71 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 VAMP5O95183 116 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 UCP3P55916 312 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 C1QL4Q86Z23 238 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF100Q8IYN0 542 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8G5Q8NG78 346 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 SPACA1Q9HBV2 294 aa22.47■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 FABP1P07148 127 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 CLDN17P56750 224 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 LIAT1Q6ZQX7 453 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 LGI3Q8N145 548 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ERGIC1Q969X5 290 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 C18orf12Q96KH6 178 aa22.46■■□□□ 1.19
CAPNS1-201ENST00000246533 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 FAHP16930 419 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF616Q08AN1 781 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPO2Q5TGU0 170 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 NANPQ8TBE9 248 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM3Q9BZL3 60 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC7A10Q9NS82 523 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 LRBAP50851 2863 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R036 132 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ST8SIA3O43173 380 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV2-5P01817 119 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM225BP0DP42 221 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 GABRR1P24046 479 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 S100PP25815 95 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 AAED1Q7RTV5 226 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 NPRL2Q8WTW4 380 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 APH1AQ96BI3 265 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 POM121Q96HA1 1249 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 TMED3Q9Y3Q3 217 aa22.45■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SCGB1D2O95969 90 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ACKR3P25106 362 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 SRPXP78539 464 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51M1Q9H341 326 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 CRIM1Q9NZV1 1036 aa22.44■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 APCP25054 2843 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF850A8MQ14 1090 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 UMAD1C9J7I0 102 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 F5H5K5 113 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ANOS1P23352 680 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf135Q5VTT2 229 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 ASCL4Q6XD76 172 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC18Q8N456 261 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 NOTCH2Q04721 2471 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 BTBD17A6NE02 478 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R135 149 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 LYZL6O75951 148 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 RSU1Q15404 277 aa22.43■■□□□ 1.18
CAPNS1-201ENST00000246533 AKIRIN2Q53H80 203 aa22.43■■□□□ 1.18
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