RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 SSMEM1Q8WWF3 244 aa18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 SULT4A1Q9BR01 284 aa18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 CENPOQ9BU64 300 aa18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 CHIAQ9BZP6 476 aa18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 ZNF286AQ9HBT8 521 aa18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF19Q9NS68 423 aa18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 ETAA1Q9NY74 926 aa18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 POMT1Q9Y6A1 747 aa18.06■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 A0A0B4J203 849 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 SMIM30A4D0T7 59 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 FAM172BPA6NC97 362 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 SOCS1O15524 211 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 IGLV1-47P01700 117 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 SMIM18P0DKX4 95 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 SSTR5P35346 364 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 TMEM50BP56557 158 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 C16orf87Q6PH81 154 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 C6orf201Q7Z4U5 140 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 OR4P4Q8NGL7 312 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 PIFOQ8TCI5 191 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 NEK7Q8TDX7 302 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 CLEC7AQ9BXN2 247 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 TENM1Q9UKZ4 2725 aa18.05■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 TMEM89A2RUT3 159 aa18.04■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 AIPO00170 330 aa18.04■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 GZMHP20718 246 aa18.04■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 EFNB2P52799 333 aa18.04■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 OR52W1Q6IF63 320 aa18.04■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 SPATA3Q8NHX4 192 aa18.04■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 FAAP24Q9BTP7 215 aa18.04■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 CA11O75493 328 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 CLEC2LP0C7M8 214 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 SDC2P34741 201 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 LGALS4P56470 323 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 NKAPLQ5M9Q1 402 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 Q6ZPA2 131 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 TPRA1Q86W33 373 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 OR4K15Q8NH41 348 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 MALSU1Q96EH3 234 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 NOTOA8MTQ0 251 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 H3BUI4 141 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 ORC5O43913 435 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 PAHP00439 452 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 C5orf24Q7Z6I8 188 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 OR10A7Q8NGE5 316 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 UBALD1Q8TB05 177 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 KCTD7Q96MP8 289 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 NEDD4LQ96PU5 975 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 LIN7BQ9HAP6 207 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SYF2-201ENST00000236273 FAM181BA6NEQ2 426 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 C12orf77C9JDV5 145 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 HKR1P10072 659 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 NFYBP25208 207 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 TGFBR1P36897 503 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 LOXL3P58215 753 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 MINOS1Q5TGZ0 78 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 LEAP2Q969E1 77 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 ARL11Q969Q4 196 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 SSX3Q99909 188 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 DPAGT1Q9H3H5 408 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 RAB22AQ9UL26 194 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 VGLL3A8MV65 326 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 LY6LH3BQJ8 138 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-7P01780 117 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 COMPP49747 757 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 VEGFCP49767 419 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 SSX2Q16385 188 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 AANATQ16613 207 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 LTC4SQ16873 150 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 MOGAT2Q3SYC2 334 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 PLAC9Q5JTB6 97 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 HSF4Q9ULV5 492 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 PSG11Q9UQ72 335 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 F2RL2O00254 374 aa17.99■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 NAPSAO96009 420 aa17.99■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 RELBQ01201 579 aa17.99■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 HLA-DRB5Q30154 266 aa17.99■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 VCX3AQ9NNX9 186 aa17.99■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa17.99■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 KCNK7Q9Y2U2 307 aa17.99■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 H3BUX3 64 aa17.98■□□□□ 0.47
SYF2-201ENST00000236273 J3QR06 171 aa17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms