RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222266.2

PSENEN-201, Transcript of presenilin enhancer, gamma-secretase subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSENEN, Length 603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSENEN-201ENST00000222266 STEAP3Q658P3 488 aa8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 BRICD5Q6PL45 260 aa8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 FGFRL1Q8N441 504 aa8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 OR4K15Q8NH41 348 aa8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 CCDC107Q8WV48 283 aa8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 TNFRSF14Q92956 283 aa8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 ISOC1Q96CN7 298 aa8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 COQ2Q96H96 371 aa8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 NICN1Q9BSH3 213 aa8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 PECRQ9BY49 303 aa8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 ABCG5Q9H222 651 aa8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 GNG12Q9UBI6 72 aa8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 ABCA1O95477 2261 aa8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 ACANP16112 2415 aa8.37□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 CR1P17927 2039 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 MEIOCA2RUB1 952 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 NPFFO15130 113 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 HSPA12AO43301 675 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 TCF21O43680 179 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 TPPPO94811 219 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 ARG1P05089 322 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 CTXN2P0C2S0 81 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 S100A5P33763 92 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 Q3ZCU0 254 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 TMEM69Q5SWH9 247 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 MINOS1Q5TGZ0 78 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 IL17RELQ6ZVW7 336 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 NR2C2APQ86WQ0 139 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 PNKDQ8N490 385 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 PRR18Q8N4B5 295 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 DTX3Q8N9I9 347 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 NDNFQ8TB73 568 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 TBX15Q96SF7 602 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 SULT4A1Q9BR01 284 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 DPAGT1Q9H3H5 408 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 GHITMQ9H3K2 345 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 CSPG4Q6UVK1 2322 aa8.36□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 AKAP9Q99996 3911 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 TRAV18A0A075B6X5 111 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 A0A0B4J203 849 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 RAB27BO00194 218 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 XRCC3O43542 346 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 DTYMKP23919 212 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 ZBTB25P24278 435 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 COX7A1P24310 79 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 HTR1DP28221 377 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 HTD2P86397 168 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 HACD4Q5VWC8 232 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 GAPTQ8N292 157 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 Q8N7P7 452 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 OR9G1Q8NH87 305 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 MALSU1Q96EH3 234 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 KCNK15Q9H427 330 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 ZNF286AQ9HBT8 521 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 OR2S2Q9NQN1 319 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 BATF3Q9NR55 127 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 ABCB10Q9NRK6 738 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 AK3Q9UIJ7 227 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 MED13LQ71F56 2210 aa8.35□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa8.34□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 LEUTXA8MZ59 168 aa8.34□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 OOSP1A8MZH6 123 aa8.34□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 TRDCB7Z8K6 153 aa8.34□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.34□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 H3BMQ9 156 aa8.34□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 FCN3O75636 299 aa8.34□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 DIRAS3O95661 229 aa8.34□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 NAPSAO96009 420 aa8.34□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 AVPP01185 164 aa8.34□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 HBZP02008 142 aa8.34□□□□□ -1.07
PSENEN-201ENST00000222266 GNB3P16520 340 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms